17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1061 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_1061  hypothetical protein  100 
 
 
228 aa  470  1e-132  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1682  hypothetical protein  57.52 
 
 
230 aa  275  4e-73  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1100  hypothetical protein  41.94 
 
 
221 aa  182  4.0000000000000006e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.228679  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2231  hypothetical protein  38.71 
 
 
238 aa  157  2e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.938381  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3293  hypothetical protein  33.94 
 
 
276 aa  120  9.999999999999999e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0451573  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1739  hypothetical protein  32.14 
 
 
231 aa  117  9.999999999999999e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2320  tetratricopeptide domain-containing protein  31.74 
 
 
229 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1556  hypothetical protein  33.17 
 
 
222 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1865  hypothetical protein  35.29 
 
 
175 aa  108  9.000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0259041  normal  0.0449521 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1769  uncharacterized protein-like protein  32.88 
 
 
218 aa  104  1e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00195397  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1598  hypothetical protein  28.86 
 
 
407 aa  94.7  1e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.303519  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0457  cyclic nucleotide-binding protein  31.25 
 
 
384 aa  90.5  2e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.95822  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0367  hypothetical protein  24.19 
 
 
218 aa  72.4  0.000000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.090753  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0349  hypothetical protein  24.19 
 
 
218 aa  72.8  0.000000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00317659  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1715  uncharacterized protein-like protein  24.88 
 
 
220 aa  57.4  0.0000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0306638  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0153  hypothetical protein  24 
 
 
222 aa  57  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0283  hypothetical protein  23.81 
 
 
217 aa  56.6  0.0000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0181263  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>