17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1682 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_1682  hypothetical protein  100 
 
 
230 aa  474  1e-133  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1061  hypothetical protein  58.53 
 
 
228 aa  270  1e-71  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1100  hypothetical protein  45.16 
 
 
221 aa  201  8e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.228679  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2231  hypothetical protein  38.64 
 
 
238 aa  156  3e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.938381  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3293  hypothetical protein  35.68 
 
 
276 aa  133  1.9999999999999998e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0451573  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1739  hypothetical protein  33.94 
 
 
231 aa  128  6e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2320  tetratricopeptide domain-containing protein  32.56 
 
 
229 aa  118  7e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1769  uncharacterized protein-like protein  34.09 
 
 
218 aa  107  1e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00195397  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1556  hypothetical protein  32.27 
 
 
222 aa  105  7e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1865  hypothetical protein  33.91 
 
 
175 aa  100  1e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0259041  normal  0.0449521 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0457  cyclic nucleotide-binding protein  26.61 
 
 
384 aa  84.7  0.000000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.95822  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1598  hypothetical protein  25.24 
 
 
407 aa  78.6  0.00000000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.303519  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0367  hypothetical protein  23.38 
 
 
218 aa  65.1  0.0000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.090753  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0349  hypothetical protein  23.38 
 
 
218 aa  64.7  0.000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00317659  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1715  uncharacterized protein-like protein  21.95 
 
 
220 aa  58.9  0.00000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0306638  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0153  hypothetical protein  25.45 
 
 
222 aa  55.8  0.0000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1142  hypothetical protein  22.96 
 
 
222 aa  42.4  0.005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>