15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0153 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0153  hypothetical protein  100 
 
 
222 aa  449  1e-125  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1100  hypothetical protein  26.94 
 
 
221 aa  65.1  0.0000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.228679  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2231  hypothetical protein  24.19 
 
 
238 aa  59.7  0.00000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.938381  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2320  tetratricopeptide domain-containing protein  26.64 
 
 
229 aa  56.2  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1682  hypothetical protein  25.45 
 
 
230 aa  55.8  0.0000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1061  hypothetical protein  24.87 
 
 
228 aa  54.7  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1739  hypothetical protein  26.29 
 
 
231 aa  51.2  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1556  hypothetical protein  25.65 
 
 
222 aa  50.4  0.00002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1865  hypothetical protein  24.29 
 
 
175 aa  48.1  0.00009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0259041  normal  0.0449521 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0367  hypothetical protein  21.7 
 
 
218 aa  47.8  0.0001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.090753  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1142  hypothetical protein  31.87 
 
 
222 aa  47.4  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0349  hypothetical protein  21.23 
 
 
218 aa  46.6  0.0003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00317659  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1769  uncharacterized protein-like protein  20.57 
 
 
218 aa  45.1  0.0009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00195397  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0283  hypothetical protein  29.82 
 
 
217 aa  43.9  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0181263  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0457  cyclic nucleotide-binding protein  27.27 
 
 
384 aa  43.1  0.004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.95822  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>