191 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_R0002 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008578  Acel_R0002  tRNA-Ala  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14002  tRNA-Ala  89.04 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0037  tRNA-Ala  88.06 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00519956  normal  0.826758 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0018  tRNA-Ala  88.06 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0605541  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0027  tRNA-Ala  88.06 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.877101  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0002  tRNA-Ala  89.66 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.157867  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0002  tRNA-Ala  89.66 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0002  tRNA-Ala  87.72 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0002  tRNA-Ala  87.72 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0002  tRNA-Ala  84.93 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.30172 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0050  tRNA-Ala  84.93 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00215399  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0018  tRNA-Ala  84.93 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000012168  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0002  tRNA-Ala  84.93 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0017  tRNA-Ala  94.59 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.476615  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13041  hypothetical protein  100 
 
 		 165 bp  56  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.195099 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0013  tRNA-Ala  100 
 
 		 73 bp  56  0.000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0927028  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNAAlaVIMSS1309346  tRNA-Ala  100 
 
 		 73 bp  56  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.190165 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0021  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.584667  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0032  tRNA-Ala  100 
 
 		 73 bp  56  0.000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0030  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0510531  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_tRNAAlaVIMSS1309149  tRNA-Ala  100 
 
 		 73 bp  56  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0382478  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNAAlaVIMSS1309073  tRNA-Ala  100 
 
 		 73 bp  56  0.000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_tRNAAlaVIMSS1309191  tRNA-Ala  100 
 
 		 73 bp  56  0.000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNAAlaVIMSS1309258  tRNA-Ala  100 
 
 		 73 bp  56  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.195414 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_R0056  tRNA-Ala  92.31 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0010  tRNA-Ala  92.31 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00600624  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_R0070  tRNA-Ala  92.31 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.756512  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0012  tRNA-Ala  92.31 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00270892  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0020  tRNA-Ala  92.31 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0004  tRNA-Ala  92.31 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000000194526  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0009  tRNA-Ala  92.31 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.0000731062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0006  tRNA-Ala  92.31 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0860739  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0011  tRNA-Ala  92.31 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.193139  normal  0.133058 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0012  tRNA-Ala  92.31 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0010  tRNA-Ala  92.31 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000320815  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0004  tRNA-Ala  92.31 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000000388071  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0041  tRNA-Ala  92.31 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0709552  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0002  tRNA-Ala  86.21 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0003  tRNA-Ala  86.21 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0411773  normal  0.562233 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0003  tRNA-Val  100 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0002  tRNA-Ala  86.21 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.22367  normal  0.0175054 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0002  tRNA-Ala  86.21 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.534142 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0002  tRNA-Ala  86.21 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.353187  normal  0.0609648 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0002  tRNA-Ala  91.89 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0064  tRNA-Ala  83.56 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0039  tRNA-Ala  91.89 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.436106  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0070  tRNA-Ala  85.96 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0037  tRNA-Ala  83.56 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.822608  normal  0.125193 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0052  tRNA-Ala  85.96 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0002  tRNA-Ala  85.96 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0002  tRNA-Ala  85.96 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0057  tRNA-Ala  91.89 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0965803  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0009  tRNA-Ala  91.89 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0031  tRNA-Ala  83.56 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000044944  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0006  tRNA-Lys  100 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_R0072  tRNA-Ala  83.56 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.665456  hitchhiker  0.000486615 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0002  tRNA-Ala  85.96 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000000554808 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0047  tRNA-Val  85.71 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.530406  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0016  tRNA-Ala  85.71 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.000587124  normal  0.11774 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0027  tRNA-Ala  85.71 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.000535173  decreased coverage  0.000361063 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_tRNAAlaVIMSS1309124  tRNA-Ala  96.43 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.127335  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16771  hypothetical protein  96.43 
 
 		 120 bp  48.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.147868  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR_t32  tRNA-Ala  89.74 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.318982  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Thr-5  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000184905  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Thr-3  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000633532  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Ala-4  tRNA-Ala  89.74 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00103294  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA_tRNA-Ala-2  tRNA-Ala  89.74 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000191328  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_2145  hypothetical protein  100 
 
 		 105 bp  46.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.960506  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3560  tRNA-Ala  89.74 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000000184914  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1910  tRNA-Ala  89.74 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000000831958  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_4354  tRNA-Ala  89.74 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.118152  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_CR0086  tRNA-Ala  89.74 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000211919  normal  0.116016 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0017  tRNA-Ala  89.74 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000773583  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0027  tRNA-Ala  89.74 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000717749  normal  0.842688 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0073  tRNA-Ala  89.74 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000273408  normal  0.460753 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_BR0003  tRNA-Ala  89.74 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000137148  normal  0.888294 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0452  tRNA-Ala  89.74 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00000943072  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0038  tRNA-Ala  89.74 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00088301  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0053  tRNA-Ala  89.74 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00546912  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0064  tRNA-Ala  89.74 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00130202  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_R0073  tRNA-Ala  89.74 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0010324  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0042  tRNA-Ala  89.74 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0052  tRNA-Ala  89.74 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0009  tRNA-Ala  89.74 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000573658  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0019  tRNA-Ala  89.74 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000594786  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0065  tRNA-Ala  89.74 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000000118515  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_R0082  tRNA-Ala  89.74 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000696423  normal  0.0186917 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_R0088  tRNA-Ala  89.74 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000671858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3542  tRNA-Ala  89.74 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00175783  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0700  tRNA-Ala  89.74 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000193557  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1989  tRNA-Ala  89.74 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000000000370393  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0004  tRNA-Ala  89.74 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_R0052  tRNA-Ala  89.74 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_R0059  tRNA-Ala  89.74 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_R0065  tRNA-Ala  89.74 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1330  tRNA-Ala  89.74 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00172601  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0593  tRNA-Ala  89.74 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00108095  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1339  tRNA-Ala  89.74 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3567  tRNA-Ala  89.74 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0488975  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3831  tRNA-Ala  89.74 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.394799  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>