299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_R0032 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_R0032  tRNA-Ala  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNAAlaVIMSS1309258  tRNA-Ala  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.195414 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0013  tRNA-Ala  94.52 
 
 		 73 bp  113  6e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0927028  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0030  tRNA-Ala  94.52 
 
 		 76 bp  113  6e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0510531  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_tRNAAlaVIMSS1309149  tRNA-Ala  94.52 
 
 		 73 bp  113  6e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0382478  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13041  hypothetical protein  93.15 
 
 		 165 bp  105  1e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.195099 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNAAlaVIMSS1309346  tRNA-Ala  93.15 
 
 		 73 bp  105  1e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.190165 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0021  tRNA-Ala  93.15 
 
 		 76 bp  105  1e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.584667  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNAAlaVIMSS1309073  tRNA-Ala  93.15 
 
 		 73 bp  105  1e-21  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_tRNAAlaVIMSS1309191  tRNA-Ala  93.15 
 
 		 73 bp  105  1e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_tRNAAlaVIMSS1309124  tRNA-Ala  91.78 
 
 		 73 bp  97.6  3e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.127335  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0040  tRNA-Ala  90.41 
 
 		 73 bp  89.7  8e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.403518  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0016  tRNA-Ala  90.41 
 
 		 76 bp  89.7  8e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.262033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0062  tRNA-Ala  90.41 
 
 		 76 bp  89.7  8e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0469123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0057  tRNA-Ala  90.41 
 
 		 76 bp  89.7  8e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.185628  hitchhiker  0.000293533 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0045  tRNA-Ala  90.41 
 
 		 76 bp  89.7  8e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0148496  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t18  tRNA-Ala  90.41 
 
 		 76 bp  89.7  8e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000569276  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0048  tRNA-Ala  90.41 
 
 		 73 bp  89.7  8e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000617749  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0050  tRNA-Ala  93.44 
 
 		 73 bp  89.7  8e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0531103 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0072  tRNA-Ala  90.41 
 
 		 76 bp  89.7  8e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.064194  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0067  tRNA-Ala  90.41 
 
 		 76 bp  89.7  8e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000523585  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0049  tRNA-Ala  90.41 
 
 		 73 bp  89.7  8e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000594982  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0045  tRNA-Ala  90.41 
 
 		 73 bp  89.7  8e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.215104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08590  tRNA-Ala  89.04 
 
 		 73 bp  81.8  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000156389 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70890  tRNA-Ala  89.04 
 
 		 73 bp  81.8  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.419729 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0039  tRNA-Ala  95.92 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.000377805  hitchhiker  0.000399875 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60560  tRNA-Ala  89.04 
 
 		 73 bp  81.8  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.0012077  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0043  tRNA-Ala  95.92 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62070  tRNA-Ala  89.04 
 
 		 73 bp  81.8  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0493865 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11500  tRNA-Ala  95.92 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.931498  hitchhiker  0.0025263 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0039  tRNA-Ala  95.92 
 
 		 73 bp  81.8  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000954288 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5401  tRNA-Ala  89.04 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0384247  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0050  tRNA-Ala  89.04 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0108182  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0042  tRNA-Ala  95.92 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0324793  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0050  tRNA-Ala  89.04 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00234368 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0044  tRNA-Ala  95.92 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55634  tRNA-Ala  89.04 
 
 		 73 bp  81.8  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.269014 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60170  tRNA-Ala  89.04 
 
 		 73 bp  81.8  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000756055  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60100  tRNA-Ala  89.04 
 
 		 73 bp  81.8  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.386359  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0813  tRNA-Ala  89.04 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.465063  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60350  tRNA-Ala  89.04 
 
 		 73 bp  81.8  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.094178  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6151  tRNA-Ala  89.04 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.140064  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4844  tRNA-Ala  89.04 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.054319  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0018  tRNA-Ala  89.04 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0040  tRNA-Ala  95.92 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000987892 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60390  tRNA-Ala  89.04 
 
 		 73 bp  81.8  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0878847  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0041  tRNA-Ala  95.92 
 
 		 73 bp  81.8  0.00000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00164455  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60010  tRNA-Ala  89.04 
 
 		 73 bp  81.8  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0174711  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR_t01  tRNA-Ala  94 
 
 		 73 bp  75.8  0.000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.126488  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0067  tRNA-Ala  91.38 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00925323  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0058  tRNA-Ala  94 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000693286  normal  0.541415 
 
 
-
 
NC_006368  lppt02  tRNA-Ala  89.39 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt11  tRNA-Ala  89.39 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt02  tRNA-Ala  89.39 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt11  tRNA-Ala  89.39 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0054  tRNA-Ala  94 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000876029  normal  0.742043 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0056  tRNA-Ala  94 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000771632  normal  0.557555 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0022  tRNA-Ala  94 
 
 		 78 bp  75.8  0.000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.331538  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0040  tRNA-Ala  91.38 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0690466  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0002  tRNA-Ala  94 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0010  tRNA-Ala  91.38 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.560104  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0018  tRNA-Ala  87.67 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000012168  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0050  tRNA-Ala  87.67 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00215399  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0025  tRNA-Ala  93.75 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.678312  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0038  tRNA-Ala  93.75 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00000224976  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0039  tRNA-Ala  93.75 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna15  tRNA-Ala  93.75 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.888051  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna17  tRNA-Ala  93.75 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16771  hypothetical protein  95.45 
 
 		 120 bp  71.9  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.147868  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0009  tRNA-Ala  90 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2507  tRNA-Ala  90 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2773  tRNA-Ala  90 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0009  tRNA-Ala  90 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0078  tRNA-Ala  90 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2213  tRNA-Ala  90 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2460  tRNA-Ala  90 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0035  tRNA-Ala  93.75 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0036  tRNA-Ala  93.75 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_t37  tRNA-Ala  92 
 
 		 73 bp  67.9  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.295961  normal  0.0193801 
 
 
-
 
NC_002947  PP_t39  tRNA-Ala  92 
 
 		 73 bp  67.9  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.304224  normal  0.0192594 
 
 
-
 
NC_002947  PP_t41  tRNA-Ala  92 
 
 		 73 bp  67.9  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0706595  normal  0.0191352 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0047  tRNA-Ala  92 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.055133  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0075  tRNA-Ala  92 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.555179 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0051  tRNA-Ala  92 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.118722  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0049  tRNA-Ala  92 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.123188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0071  tRNA-Ala  92 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.735221 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R34  tRNA-Ala  92 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0029  tRNA-Ala  92 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0737058 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0073  tRNA-Ala  92 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.555179 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0031  tRNA-Ala  92 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0725806 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0033  tRNA-Ala  92 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.106425 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0018  tRNA-Ala  92 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00619278  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_R0034  tRNA-Ala  87.88 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.36427 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0008  tRNA-Ala  92 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.224087 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_R0062  tRNA-Ala  92 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.259721  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0019  tRNA-Ala  92 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.218874 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0004  tRNA-Ala  89.66 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6047  tRNA-Ala  92 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0037  tRNA-Ala  89.66 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0234109  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0058  tRNA-Ala  89.66 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>