20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_1534 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013926  Aboo_1534  Protein of unknown function DUF54  100 
 
 
139 aa  283  7e-76  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1934  Protein of unknown function DUF54  31.94 
 
 
150 aa  84.3  5e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2500  hypothetical protein  32.61 
 
 
147 aa  82.8  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0500809  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1368  hypothetical protein  31.88 
 
 
138 aa  82  0.000000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.513254  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0587  Protein of unknown function DUF54  31.65 
 
 
147 aa  82  0.000000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0947  hypothetical protein  32.58 
 
 
174 aa  80.1  0.00000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2396  Protein of unknown function DUF54  29.2 
 
 
141 aa  79.3  0.00000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.719157 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1931  hypothetical protein  36.84 
 
 
138 aa  67  0.00000000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0193  hypothetical protein  32.05 
 
 
151 aa  65.9  0.0000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0279066  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0525  hypothetical protein  25.18 
 
 
143 aa  65.9  0.0000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.678708  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1513  hypothetical protein  34.31 
 
 
141 aa  54.3  0.0000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0099906 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1387  hypothetical protein  34.21 
 
 
146 aa  53.5  0.000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0651  hypothetical protein  31.76 
 
 
167 aa  51.6  0.000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.284614  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1374  hypothetical protein  33.87 
 
 
153 aa  50.8  0.000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0938  hypothetical protein  28.08 
 
 
138 aa  50.4  0.000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1302  hypothetical protein  33.06 
 
 
153 aa  50.1  0.00001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0933963  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0842  hypothetical protein  29.5 
 
 
138 aa  49.3  0.00002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.532651  normal  0.113262 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0389  hypothetical protein  29.93 
 
 
150 aa  46.6  0.0001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1280  hypothetical protein  31.15 
 
 
161 aa  42.7  0.001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1028  LysR family transcriptional regulator  32.39 
 
 
300 aa  40.4  0.008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>