21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_1934 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_1934  Protein of unknown function DUF54  100 
 
 
150 aa  298  1e-80  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0587  Protein of unknown function DUF54  80.67 
 
 
147 aa  243  6e-64  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0947  hypothetical protein  66.44 
 
 
174 aa  189  1e-47  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2396  Protein of unknown function DUF54  60.96 
 
 
141 aa  180  7e-45  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.719157 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0525  hypothetical protein  59.46 
 
 
143 aa  171  2.9999999999999996e-42  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.678708  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1534  Protein of unknown function DUF54  31.94 
 
 
139 aa  84.3  6e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1368  hypothetical protein  36.36 
 
 
138 aa  78.2  0.00000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.513254  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2500  hypothetical protein  35.77 
 
 
147 aa  71.6  0.000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0500809  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0193  hypothetical protein  31.21 
 
 
151 aa  65.9  0.0000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0279066  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1302  hypothetical protein  30.52 
 
 
153 aa  62.4  0.000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0933963  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0651  hypothetical protein  30.72 
 
 
167 aa  61.6  0.000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.284614  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1374  hypothetical protein  31.13 
 
 
153 aa  61.2  0.000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1311  hypothetical protein  33.11 
 
 
167 aa  58.9  0.00000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.138336  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0389  hypothetical protein  30.43 
 
 
150 aa  53.1  0.000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1513  hypothetical protein  29.85 
 
 
141 aa  52.4  0.000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0099906 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1280  hypothetical protein  26.45 
 
 
161 aa  50.8  0.000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1931  hypothetical protein  27.35 
 
 
138 aa  47.8  0.00005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0842  hypothetical protein  28.29 
 
 
138 aa  45.1  0.0004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.532651  normal  0.113262 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1387  hypothetical protein  28.86 
 
 
146 aa  43.9  0.0007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0071  hypothetical protein  35.45 
 
 
147 aa  41.2  0.004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  unclonable  0.0000000000262103  hitchhiker  0.00974404 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1750  hypothetical protein  33.33 
 
 
118 aa  40.4  0.007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>