24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0938 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009073  Pcal_0938  hypothetical protein  100 
 
 
138 aa  277  3e-74  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0842  hypothetical protein  66.92 
 
 
138 aa  188  2e-47  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.532651  normal  0.113262 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1931  hypothetical protein  65.41 
 
 
138 aa  188  2e-47  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1387  hypothetical protein  66.92 
 
 
146 aa  182  2.0000000000000003e-45  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0389  hypothetical protein  36.11 
 
 
150 aa  75.1  0.0000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0766  hypothetical protein  40.57 
 
 
118 aa  65.9  0.0000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.579057 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1852  hypothetical protein  29.93 
 
 
161 aa  64.3  0.0000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0503  hypothetical protein  37.74 
 
 
130 aa  63.9  0.0000000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1750  hypothetical protein  37.27 
 
 
118 aa  62  0.000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1798  Protein of unknown function DUF54  30.33 
 
 
149 aa  57.4  0.00000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.354083  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0712  hypothetical protein  33.33 
 
 
118 aa  56.2  0.0000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.286492 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1368  hypothetical protein  34.43 
 
 
138 aa  52.8  0.000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.513254  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1534  Protein of unknown function DUF54  28.08 
 
 
139 aa  50.4  0.000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1513  hypothetical protein  28.45 
 
 
141 aa  49.7  0.00002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0099906 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0071  hypothetical protein  31.88 
 
 
147 aa  47.4  0.00007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  unclonable  0.0000000000262103  hitchhiker  0.00974404 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1302  hypothetical protein  31.54 
 
 
153 aa  47.4  0.00007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0933963  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0587  Protein of unknown function DUF54  28.19 
 
 
147 aa  47  0.00009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1374  hypothetical protein  31.54 
 
 
153 aa  46.6  0.0001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1311  hypothetical protein  29.66 
 
 
167 aa  44.7  0.0004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.138336  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0651  hypothetical protein  31.54 
 
 
167 aa  43.9  0.0008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.284614  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0193  hypothetical protein  28.57 
 
 
151 aa  42.7  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0279066  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0947  hypothetical protein  27.56 
 
 
174 aa  42.7  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1280  hypothetical protein  25.4 
 
 
161 aa  41.6  0.004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2500  hypothetical protein  28.8 
 
 
147 aa  40.8  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0500809  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>