23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2500 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2500  hypothetical protein  100 
 
 
147 aa  297  3e-80  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0500809  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0193  hypothetical protein  60.26 
 
 
151 aa  180  7e-45  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0279066  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1368  hypothetical protein  41.78 
 
 
138 aa  110  6e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.513254  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1534  Protein of unknown function DUF54  32.61 
 
 
139 aa  82.8  0.000000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1302  hypothetical protein  36.05 
 
 
153 aa  78.2  0.00000000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0933963  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1374  hypothetical protein  36.05 
 
 
153 aa  77.4  0.00000000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0651  hypothetical protein  34.78 
 
 
167 aa  74.3  0.0000000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.284614  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0947  hypothetical protein  36.99 
 
 
174 aa  73.9  0.0000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2396  Protein of unknown function DUF54  35.04 
 
 
141 aa  72.4  0.000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.719157 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1934  Protein of unknown function DUF54  35.77 
 
 
150 aa  71.6  0.000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1852  hypothetical protein  36.59 
 
 
161 aa  67.4  0.00000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0525  hypothetical protein  33.58 
 
 
143 aa  65.1  0.0000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.678708  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1311  hypothetical protein  31.21 
 
 
167 aa  64.3  0.0000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.138336  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0587  Protein of unknown function DUF54  31.16 
 
 
147 aa  61.6  0.000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1280  hypothetical protein  28.57 
 
 
161 aa  59.7  0.00000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1513  hypothetical protein  31.69 
 
 
141 aa  57.8  0.00000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0099906 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1750  hypothetical protein  32.28 
 
 
118 aa  49.7  0.00001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0389  hypothetical protein  29.41 
 
 
150 aa  45.1  0.0003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0766  hypothetical protein  28 
 
 
118 aa  44.3  0.0005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.579057 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0712  hypothetical protein  27.2 
 
 
118 aa  43.5  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.286492 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1798  Protein of unknown function DUF54  28.57 
 
 
149 aa  42.4  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.354083  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1387  hypothetical protein  29.51 
 
 
146 aa  42  0.003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0938  hypothetical protein  28.8 
 
 
138 aa  40.8  0.006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>