17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_2396 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_2396  Protein of unknown function DUF54  100 
 
 
141 aa  283  4e-76  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.719157 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0947  hypothetical protein  67.38 
 
 
174 aa  202  1e-51  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0587  Protein of unknown function DUF54  64.54 
 
 
147 aa  195  2.0000000000000003e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0525  hypothetical protein  63.64 
 
 
143 aa  182  2.0000000000000003e-45  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.678708  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1934  Protein of unknown function DUF54  60.96 
 
 
150 aa  180  7e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1534  Protein of unknown function DUF54  29.2 
 
 
139 aa  79.3  0.00000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1368  hypothetical protein  33.59 
 
 
138 aa  75.5  0.0000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.513254  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2500  hypothetical protein  35.04 
 
 
147 aa  72.4  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0500809  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0193  hypothetical protein  32.85 
 
 
151 aa  70.9  0.000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0279066  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0651  hypothetical protein  28.95 
 
 
167 aa  49.7  0.00001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.284614  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1374  hypothetical protein  28.45 
 
 
153 aa  50.1  0.00001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1302  hypothetical protein  27.59 
 
 
153 aa  48.9  0.00002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0933963  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1931  hypothetical protein  27.03 
 
 
138 aa  49.3  0.00002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0389  hypothetical protein  28.7 
 
 
150 aa  43.9  0.0007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1311  hypothetical protein  33.33 
 
 
167 aa  43.1  0.001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.138336  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1798  Protein of unknown function DUF54  21.88 
 
 
149 aa  42.4  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.354083  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1513  hypothetical protein  24.58 
 
 
141 aa  40.8  0.007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0099906 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>