21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_0651 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009975  MmarC6_0651  hypothetical protein  100 
 
 
167 aa  332  1e-90  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.284614  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1374  hypothetical protein  98.04 
 
 
153 aa  298  3e-80  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1302  hypothetical protein  96.73 
 
 
153 aa  296  7e-80  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0933963  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1311  hypothetical protein  76.05 
 
 
167 aa  263  5.999999999999999e-70  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.138336  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1280  hypothetical protein  53.74 
 
 
161 aa  165  2.9999999999999998e-40  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2500  hypothetical protein  34.78 
 
 
147 aa  74.3  0.0000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0500809  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1852  hypothetical protein  34.38 
 
 
161 aa  69.3  0.00000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0389  hypothetical protein  35.16 
 
 
150 aa  66.2  0.0000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0947  hypothetical protein  32.19 
 
 
174 aa  62  0.000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1368  hypothetical protein  29.08 
 
 
138 aa  61.6  0.000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.513254  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1934  Protein of unknown function DUF54  30.72 
 
 
150 aa  61.6  0.000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1798  Protein of unknown function DUF54  29.93 
 
 
149 aa  60.1  0.00000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.354083  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0587  Protein of unknown function DUF54  29.87 
 
 
147 aa  56.6  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0193  hypothetical protein  30.15 
 
 
151 aa  55.1  0.0000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0279066  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0071  hypothetical protein  34.11 
 
 
147 aa  53.1  0.000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  unclonable  0.0000000000262103  hitchhiker  0.00974404 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1534  Protein of unknown function DUF54  31.76 
 
 
139 aa  51.6  0.000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2396  Protein of unknown function DUF54  28.95 
 
 
141 aa  49.7  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.719157 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0842  hypothetical protein  30.58 
 
 
138 aa  45.1  0.0005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.532651  normal  0.113262 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1513  hypothetical protein  28.91 
 
 
141 aa  44.3  0.0008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0099906 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0938  hypothetical protein  31.54 
 
 
138 aa  43.9  0.001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1931  hypothetical protein  31.53 
 
 
138 aa  43.1  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>