24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_1513 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010085  Nmar_1513  hypothetical protein  100 
 
 
141 aa  278  1e-74  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0099906 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1368  hypothetical protein  33.08 
 
 
138 aa  69.3  0.00000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.513254  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2500  hypothetical protein  31.69 
 
 
147 aa  57.8  0.00000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0500809  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1387  hypothetical protein  32.04 
 
 
146 aa  55.1  0.0000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1534  Protein of unknown function DUF54  34.31 
 
 
139 aa  54.3  0.0000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1280  hypothetical protein  30.08 
 
 
161 aa  53.1  0.000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1934  Protein of unknown function DUF54  29.85 
 
 
150 aa  52.4  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1931  hypothetical protein  29.46 
 
 
138 aa  51.6  0.000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0842  hypothetical protein  28.21 
 
 
138 aa  51.2  0.000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.532651  normal  0.113262 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0947  hypothetical protein  28.35 
 
 
174 aa  50.8  0.000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0938  hypothetical protein  28.45 
 
 
138 aa  49.7  0.00002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0071  hypothetical protein  29.32 
 
 
147 aa  48.5  0.00003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  unclonable  0.0000000000262103  hitchhiker  0.00974404 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1302  hypothetical protein  29.69 
 
 
153 aa  48.1  0.00004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0933963  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1374  hypothetical protein  29.69 
 
 
153 aa  47.4  0.00006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0766  hypothetical protein  29.66 
 
 
118 aa  46.2  0.0001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.579057 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0193  hypothetical protein  29.58 
 
 
151 aa  45.8  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0279066  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0587  Protein of unknown function DUF54  23.13 
 
 
147 aa  44.3  0.0006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0651  hypothetical protein  28.91 
 
 
167 aa  44.3  0.0006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.284614  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0389  hypothetical protein  25.42 
 
 
150 aa  43.5  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1750  hypothetical protein  29.66 
 
 
118 aa  43.1  0.001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1311  hypothetical protein  28.12 
 
 
167 aa  41.2  0.005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.138336  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2396  Protein of unknown function DUF54  24.58 
 
 
141 aa  40.8  0.007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.719157 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1798  Protein of unknown function DUF54  23.47 
 
 
149 aa  40.4  0.008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.354083  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1852  hypothetical protein  28.24 
 
 
161 aa  40.4  0.008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>