19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0947 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_0947  hypothetical protein  100 
 
 
174 aa  341  2.9999999999999997e-93  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2396  Protein of unknown function DUF54  67.38 
 
 
141 aa  203  1e-51  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.719157 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0587  Protein of unknown function DUF54  67.38 
 
 
147 aa  196  1.0000000000000001e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1934  Protein of unknown function DUF54  66.44 
 
 
150 aa  191  5e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0525  hypothetical protein  58.04 
 
 
143 aa  168  4e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.678708  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1368  hypothetical protein  39.13 
 
 
138 aa  86.7  2e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.513254  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1534  Protein of unknown function DUF54  33.33 
 
 
139 aa  79.3  0.00000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2500  hypothetical protein  36.3 
 
 
147 aa  73.9  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0500809  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0193  hypothetical protein  33.33 
 
 
151 aa  67.8  0.00000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0279066  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0651  hypothetical protein  32.64 
 
 
167 aa  62  0.000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.284614  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0389  hypothetical protein  32.59 
 
 
150 aa  62.4  0.000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1374  hypothetical protein  33.33 
 
 
153 aa  61.6  0.000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1302  hypothetical protein  32.64 
 
 
153 aa  61.2  0.000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0933963  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1311  hypothetical protein  34.67 
 
 
167 aa  57  0.0000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.138336  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1931  hypothetical protein  28.83 
 
 
138 aa  54.7  0.0000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1513  hypothetical protein  27.91 
 
 
141 aa  50.1  0.00002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0099906 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0938  hypothetical protein  28 
 
 
138 aa  42.7  0.003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0071  hypothetical protein  33.96 
 
 
147 aa  41.6  0.006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  unclonable  0.0000000000262103  hitchhiker  0.00974404 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0503  hypothetical protein  34.29 
 
 
130 aa  41.2  0.008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>