More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_R0040 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013205  Aaci_R0040  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.207175  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0049  tRNA-Ala  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.566617 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0019  tRNA-Ala  94.55 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000122889  normal  0.598483 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0040  tRNA-Ala  88.16 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000841644  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0020  tRNA-Ala  88.16 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4264  tRNA-Ala  86.84 
 
 		 78 bp  71.9  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000257856  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0047  tRNA-Ala  86.84 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000145993  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0627  tRNA-Ala  86.84 
 
 		 78 bp  71.9  0.00000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000351596  normal  0.0173581 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0034  tRNA-Ala  86.84 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.884899  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0084  tRNA-Ala  86.84 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0403496  normal  0.138563 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0031  tRNA-Ala  86.84 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0725806 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4292  tRNA-Ala  86.84 
 
 		 78 bp  71.9  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000724507  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0047  tRNA-Ala  86.84 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.055133  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4205  tRNA-Ala  86.84 
 
 		 78 bp  71.9  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000556554  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0060  tRNA-Ala  86.84 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000375554  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0039  tRNA-Ala  86.84 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0255364 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0004  tRNA-Ala  86.84 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000571046  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0103  tRNA-Ala  86.84 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000241452  normal  0.0209132 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R34  tRNA-Ala  86.84 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0017  tRNA-Ala  86.84 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00161415  hitchhiker  0.00407434 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0022  tRNA-Ala  86.84 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0023  tRNA-Ala  86.84 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0933742 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0469  tRNA-Ala  86.84 
 
 		 78 bp  71.9  0.00000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000319828  normal  0.0257822 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0128  tRNA-Ala  86.84 
 
 		 78 bp  71.9  0.00000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000050642  normal  0.0403899 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0075  tRNA-Ala  86.84 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.555179 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0033  tRNA-Ala  86.84 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.106425 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0029  tRNA-Ala  86.84 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0737058 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0051  tRNA-Ala  86.84 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.118722  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0063  tRNA-Ala  86.84 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0057  tRNA-Ala  86.84 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.328689 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0049  tRNA-Ala  86.84 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.123188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0073  tRNA-Ala  86.84 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.555179 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0071  tRNA-Ala  86.84 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.735221 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0021  tRNA-Ala  86.84 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000859233  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_t37  tRNA-Ala  86.3 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.295961  normal  0.0193801 
 
 
-
 
NC_002947  PP_t39  tRNA-Ala  86.3 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.304224  normal  0.0192594 
 
 
-
 
NC_002947  PP_t41  tRNA-Ala  86.3 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0706595  normal  0.0191352 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0011  tRNA-Ala  85.53 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0066  tRNA-Ala  85.53 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0061  tRNA-Ala  85.53 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.284612  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0039  tRNA-Ala  85.53 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.575536  normal  0.4318 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0019  tRNA-Ala  85.53 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000697155  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0030  tRNA-Ala  85.53 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000491237  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0008  tRNA-Ala  85.53 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0607736  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0025  tRNA-Ala  85.53 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0007  tRNA-Ala  85.53 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.682382  normal  0.836798 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0062  tRNA-Ala  85.53 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.170997  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0008  tRNA-Ala  85.53 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.52636  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0008  tRNA-Ala  85.53 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.142528  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0055  tRNA-Ala  85.53 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000025235  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0003  tRNA-Ala  85.53 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.897638  normal  0.0843141 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0015  tRNA-Ala  85.53 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0032  tRNA-Ala  85.53 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0017  tRNA-Ala  85.53 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0002  tRNA-Ala  85.53 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0015  tRNA-Ala  85.53 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.176699  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0019  tRNA-Ala  84.93 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0477959 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0034  tRNA-Ala  85.51 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00540131 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0011  tRNA-Ala  85.51 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0613646 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0016  tRNA-Ala  85.51 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.168843  normal  0.312064 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0030  tRNA-Ala  84.93 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0012  tRNA-Ala  84.93 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.569258  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0030  tRNA-Ala  85.51 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.546773  normal  0.473005 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0003  tRNA-Ala  85.51 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0031  tRNA-Ala  85.51 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00039  tRNA-Ala  84.21 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000221447  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00072  tRNA-Ala  84.21 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00919512  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0005  tRNA-Ala  84.21 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00430225  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0101  tRNA-Ala  84.21 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00826965  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RS04529  tRNA-Ala  84.21 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  unclonable  0.00000000942406  normal  0.305986 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0346  tRNA-Ala  84.21 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t004  tRNA-Ala  84.21 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t063  tRNA-Ala  84.21 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t095  tRNA-Ala  84.21 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t04  tRNA-Ala  84.21 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t10  tRNA-Ala  84.21 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0117548  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t16  tRNA-Ala  84.21 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.266667  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t29  tRNA-Ala  84.21 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.117493  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t31  tRNA-Ala  84.21 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.109308  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0030  tRNA-Ala  84.21 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000620846  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R14  tRNA-Ala  84.21 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000817824  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R79  tRNA-Ala  84.21 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000916269  hitchhiker  0.00756682 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R92  tRNA-Ala  84.21 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000124955  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0036  tRNA-Ala  84.21 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000477203  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0043  tRNA-Ala  84.21 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0457533  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0051  tRNA-Ala  84.21 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000604865  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0044  tRNA-Ala  84.21 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000111435  normal  0.0314224 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0029  tRNA-Ala  84.21 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000000636082  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0032  tRNA-Ala  84.21 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000000439194  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0072  tRNA-Ala  84.21 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0000523195  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0002  tRNA-Ala  84.21 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00133969  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0010  tRNA-Ala  84.21 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0312257  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0071  tRNA-Ala  84.21 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.116303  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0136  tRNA-Ala  84.21 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00216057  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0059  tRNA-Ala  84.21 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00107174  normal  0.0900334 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0060  tRNA-Ala  84.21 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00115408  normal  0.0927099 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0011  tRNA-Ala  84.21 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000768002  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0066  tRNA-Ala  84.21 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000458923  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0113  tRNA-Ala  84.21 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000340482  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0010  tRNA-Ala  84.21 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0704322  hitchhiker  0.00208971 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>