14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene pE33L466_0221 on replicon NC_007103
Organism: Bacillus cereus E33L



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007103  pE33L466_0221  TraG/TraD family conjugal transfer protein  100 
 
 		 1025 aa  2127    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0215  conjugation protein, TraG/TraD family  50.16 
 
 		 792 aa  590  1e-167  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0073  TraG/TraD family protein  43.21 
 
 		 1166 aa  568  1e-160  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0093  conjugation protein, TraG/TraD family  43.21 
 
 		 1166 aa  568  1e-160  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0064  conjugation protein, TraG/TraD family  43.21 
 
 		 1166 aa  568  1e-160  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0064  TraG/TraD family conjugal transfer protein  40.83 
 
 		 1109 aa  544  1e-153  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3017  hypothetical protein  22.9 
 
 		 828 aa  79.3  0.0000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7330  type IV secretory pathway VirD4 components-like protein  29.87 
 
 		 719 aa  55.1  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0000633696  decreased coverage  0.00000000626768 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6729  Type IV secretory pathway VirD4 protein-like protein  28 
 
 		 830 aa  52.8  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.577691  normal  0.546954 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6838  Type IV secretory pathway VirD4 protein-like protein  27.81 
 
 		 633 aa  49.7  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00343153  normal  0.0724614 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1694  Type IV secretory pathway VirD4 components-like  26.88 
 
 		 832 aa  48.1  0.0008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000925009  normal  0.0597569 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0314  hypothetical protein  28.1 
 
 		 425 aa  47.4  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5981  hypothetical protein  30.1 
 
 		 747 aa  46.2  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2549  hypothetical protein  25.62 
 
 		 832 aa  44.7  0.01  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.207629  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>