46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp1161 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006368  lpp1161  hypothetical protein  100 
 
 
345 aa  678    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1167  hypothetical protein  98.84 
 
 
345 aa  671    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2621  hypothetical protein  49.7 
 
 
331 aa  311  1e-83  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0610  hypothetical protein  35.21 
 
 
349 aa  204  2e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00052369  normal  0.703686 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1120  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.63 
 
 
342 aa  183  4.0000000000000006e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.575682  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1103  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.64 
 
 
352 aa  170  3e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0805  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.35 
 
 
286 aa  53.1  0.000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.570696 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1867  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.81 
 
 
308 aa  52.4  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2405  hypothetical protein  28.47 
 
 
352 aa  50.4  0.00004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0672  hypothetical protein  26.39 
 
 
325 aa  48.9  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.176077  normal  0.524236 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5885  hypothetical protein  24.32 
 
 
302 aa  48.9  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2192  hypothetical protein  24.32 
 
 
302 aa  48.9  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.702436  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3468  hypothetical protein  25.82 
 
 
297 aa  48.9  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.889932  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4318  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.06 
 
 
305 aa  48.5  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.342879 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1695  hypothetical protein  29.45 
 
 
311 aa  48.1  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4208  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.06 
 
 
305 aa  48.5  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0577458  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2469  hypothetical protein  24.19 
 
 
304 aa  47  0.0005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2217  hypothetical protein  22.35 
 
 
302 aa  46.6  0.0007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.207326  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2231  hypothetical protein  23.62 
 
 
302 aa  46.2  0.0008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.556701  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2617  hypothetical protein  24.19 
 
 
304 aa  46.2  0.0008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1938  hypothetical protein  22.93 
 
 
299 aa  46.2  0.0009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0626  hypothetical protein  22.93 
 
 
299 aa  46.2  0.0009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.750963  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0529  hypothetical protein  22.93 
 
 
299 aa  46.2  0.0009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2110  hypothetical protein  23.25 
 
 
302 aa  45.8  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.244484  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1123  membrane protein; drug/metabolite exporter family protein  24.15 
 
 
303 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4059  hypothetical protein  25.51 
 
 
303 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0153728  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1311  hypothetical protein  24.23 
 
 
303 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000102965 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1285  hypothetical protein  24.13 
 
 
303 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.150525  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1137  hypothetical protein  25.17 
 
 
303 aa  45.1  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0899192  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5521  hypothetical protein  23.89 
 
 
297 aa  45.1  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.459565  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1130  membrane protein; drug/metabolite exporter family protein  24.23 
 
 
303 aa  45.1  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0451138  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4184  hypothetical protein  23.31 
 
 
319 aa  44.7  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1243  hypothetical protein  24.23 
 
 
303 aa  45.4  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.142869  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1149  hypothetical protein  24.23 
 
 
303 aa  45.4  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1388  hypothetical protein  23.88 
 
 
303 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00161471  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1956  hypothetical protein  23.77 
 
 
318 aa  44.3  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.209057  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2918  hypothetical protein  24.11 
 
 
315 aa  43.9  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103188  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2848  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.16 
 
 
300 aa  43.9  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1447  hypothetical protein  22.8 
 
 
301 aa  43.5  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.23861  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2271  hypothetical protein  22.78 
 
 
308 aa  43.5  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0233167  normal  0.0209827 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1132  hypothetical protein  33.78 
 
 
310 aa  43.1  0.007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1350  hypothetical protein  23.88 
 
 
309 aa  43.1  0.007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.287867  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0097  hypothetical protein  25.19 
 
 
304 aa  42.7  0.01  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.112407  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0265  hypothetical protein  25.5 
 
 
307 aa  42.7  0.01  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.726467  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1205  hypothetical protein  27.22 
 
 
317 aa  42.7  0.01  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0875949  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2018  hypothetical protein  22.44 
 
 
299 aa  42.7  0.01  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0623689  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>