30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp0502 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006368  lpp0502  hypothetical protein  100 
 
 
203 aa  419  1e-116  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0478  hypothetical protein  94.03 
 
 
206 aa  392  1e-108  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4807  Methyltransferase type 12  40.3 
 
 
205 aa  150  8e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5280  methyltransferase type 12  35.71 
 
 
207 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.680539 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6048  methyltransferase type 11  34.72 
 
 
217 aa  122  5e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.19889  normal  0.724013 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0609  Methyltransferase type 12  30.35 
 
 
202 aa  99.4  4e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.763515  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06550  dimethyladenosine transferase  31 
 
 
195 aa  88.2  8e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000671  SAM-dependent methyltransferase  29.5 
 
 
195 aa  84.3  0.000000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.190195  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11850  methyltransferase family protein  27.23 
 
 
199 aa  81.3  0.000000000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0785893  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31140  methyltransferase family protein  28.24 
 
 
179 aa  73.6  0.000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5085  methyltransferase type 12  32.35 
 
 
226 aa  53.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0258  UbiE/COQ5 family methlytransferase  30.69 
 
 
250 aa  50.8  0.00001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4275  Methyltransferase type 11  31.78 
 
 
203 aa  47  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.18004 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2049  methyltransferase type 12  28.95 
 
 
246 aa  45.8  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.690149  normal  0.594586 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0214  Methyltransferase type 11  35.94 
 
 
217 aa  45.1  0.0007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0641979  hitchhiker  0.00422733 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80971  predicted protein  28.32 
 
 
377 aa  43.9  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2612  methyltransferase type 11  24.09 
 
 
208 aa  43.5  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.353861  normal  0.593702 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1625  methyltransferase type 12  27.7 
 
 
229 aa  43.9  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1584  methyltransferase type 11  33.87 
 
 
250 aa  42.7  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2614  methyltransferase small  31.17 
 
 
202 aa  43.1  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0995  methyltransferase type 11  29.37 
 
 
210 aa  43.1  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.304036  normal  0.338682 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4009  methyltransferase GidB  35.11 
 
 
231 aa  42.4  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00213525  hitchhiker  0.00000000363002 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2429  hypothetical protein  26.15 
 
 
267 aa  42  0.006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0353456 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2151  methyltransferase  26.15 
 
 
267 aa  42  0.006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2038  putative methyltransferase  26.15 
 
 
267 aa  42  0.006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3915  methyltransferase type 11  34 
 
 
290 aa  42  0.007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.525409  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0482  Methyltransferase type 12  31.94 
 
 
204 aa  42  0.007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.276366 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2899  hypothetical protein  22.92 
 
 
236 aa  41.6  0.008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000010502  normal  0.0506013 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1585  hypothetical protein  26.87 
 
 
256 aa  41.6  0.009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5293  Methyltransferase type 12  23.75 
 
 
214 aa  41.2  0.01  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>