63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_0263 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_0263  carboxylate/amino acid/amine transporter  100 
 
 		 299 aa  597  1e-170  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3954  carboxylate/amino acid/amine transporter  100 
 
 		 299 aa  597  1e-170  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0240  carboxylate/amino acid/amine transporter  86.57 
 
 		 287 aa  488  1e-137  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.214328 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3969  carboxylate/amino acid/amine transporter  77.93 
 
 		 299 aa  477  1e-133  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4358  carboxylate/amino acid/amine transporter  75.25 
 
 		 299 aa  465  9.999999999999999e-131  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4075  carboxylate/amino acid/amine transporter  74.25 
 
 		 299 aa  455  1e-127  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.126831  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4194  10 TMS drug/metabolite exporter (DME) family protein  72.91 
 
 		 299 aa  454  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00209407 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4051  10 TMS drug/metabolite exporter (DME) family protein  72.58 
 
 		 299 aa  452  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4349  10 TMS drug/metabolite exporter (DME) family protein  72.58 
 
 		 299 aa  452  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4181  carboxylate/amino acid/amine transporter  72.58 
 
 		 299 aa  452  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0864049 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4294  10 TMS Drug/Metabolite Exporter (DME) family  72.58 
 
 		 299 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03655  hypothetical protein  72.91 
 
 		 299 aa  454  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03706  predicted inner membrane protein  72.91 
 
 		 299 aa  454  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4152  carboxylate/amino acid/amine transporter  72.58 
 
 		 299 aa  452  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3936  carboxylate/amino acid/amine transporter  71.38 
 
 		 318 aa  434  1e-120  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0183  carboxylate/amino acid/amine transporter  72.24 
 
 		 299 aa  421  1e-117  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1235  carboxylate/amino acid/amine transporter  55.79 
 
 		 291 aa  315  7e-85  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2439  MadN protein  55.67 
 
 		 295 aa  311  9e-84  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001947  putative acetate efflux pump MadN  55.09 
 
 		 292 aa  306  3e-82  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00531  permease  54.74 
 
 		 292 aa  306  4.0000000000000004e-82  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1920  inner membrane protein  53.6 
 
 		 284 aa  297  2e-79  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0119644  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3134  hypothetical protein  51.85 
 
 		 292 aa  292  4e-78  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2726  hypothetical protein  52.86 
 
 		 286 aa  291  6e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.054013  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01531  putative MadN protein  51.24 
 
 		 287 aa  286  2e-76  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.997992  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2175  protein of unknown function DUF6 transmembrane  50.17 
 
 		 289 aa  281  7.000000000000001e-75  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000121987  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0684  hypothetical protein  48.42 
 
 		 287 aa  276  3e-73  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1276  hypothetical protein  47.18 
 
 		 288 aa  274  1.0000000000000001e-72  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00521241  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0261  hypothetical protein  55.43 
 
 		 290 aa  272  5.000000000000001e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1302  MadN protein  51.21 
 
 		 291 aa  271  1e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1652  hypothetical protein  55.91 
 
 		 286 aa  266  2e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1236  hypothetical protein  50.96 
 
 		 265 aa  266  2.9999999999999995e-70  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.294327  normal  0.0827717 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19150  hypothetical protein  56.27 
 
 		 286 aa  265  5e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.475633 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1597  hypothetical protein  52.16 
 
 		 292 aa  264  1e-69  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.483215  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1433  carboxylate/amino acid/amine transporter  48.55 
 
 		 293 aa  254  8e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.720857  normal  0.464968 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0339  hypothetical protein  52.52 
 
 		 292 aa  251  8.000000000000001e-66  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.252118  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4083  hypothetical protein  45.52 
 
 		 292 aa  242  5e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.114876  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4537  carboxylate/amino acid/amine transporter  49.28 
 
 		 291 aa  240  2e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.778946  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1354  carboxylate/amino acid/amine transporter  49.28 
 
 		 291 aa  240  2e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.117278 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3830  carboxylate/amino acid/amine transporter  49.28 
 
 		 291 aa  239  4e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.714996 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4043  carboxylate/amino acid/amine transporter  46.38 
 
 		 291 aa  236  3e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.791434 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1301  carboxylate/amino acid/amine transporter  50.91 
 
 		 290 aa  233  3e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.546965 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3822  hypothetical protein  45.17 
 
 		 292 aa  230  2e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0047105 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0974  conserved hypothetical protein, MadN family (DUF6 domain protein)  36.03 
 
 		 292 aa  198  1.0000000000000001e-49  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.634271  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2636  hypothetical protein  36.46 
 
 		 286 aa  157  3e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1849  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.56 
 
 		 302 aa  124  2e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1702  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.11 
 
 		 302 aa  65.5  0.000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.352845  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4998  hypothetical protein  29.53 
 
 		 300 aa  56.6  0.0000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.390809  normal  0.999953 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4486  DMT family permease  23.47 
 
 		 304 aa  53.1  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0334  hypothetical protein  23.12 
 
 		 313 aa  49.3  0.00007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4259  hypothetical protein  27.66 
 
 		 299 aa  49.3  0.00007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0277  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.37 
 
 		 325 aa  48.9  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3468  hypothetical protein  24.38 
 
 		 297 aa  46.2  0.0007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.889932  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0799  hypothetical protein  28.12 
 
 		 296 aa  45.8  0.0009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.818356  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0346  hypothetical protein  28.12 
 
 		 296 aa  45.8  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.548669  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3922  hypothetical protein  28.12 
 
 		 296 aa  45.4  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.939787 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0830  hypothetical protein  28.12 
 
 		 296 aa  45.8  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.100508  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1614  hypothetical protein  27.87 
 
 		 270 aa  44.7  0.002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.90138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2271  hypothetical protein  24.19 
 
 		 308 aa  44.7  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0233167  normal  0.0209827 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3184  hypothetical protein  23.29 
 
 		 315 aa  43.9  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.546579  normal  0.703778 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2100  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.53 
 
 		 312 aa  43.9  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.10597  normal  0.402692 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1008  hypothetical protein  24.01 
 
 		 312 aa  42.7  0.007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.508617 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2918  hypothetical protein  22.77 
 
 		 315 aa  42.7  0.008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103188  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0439  YyaM  26.17 
 
 		 301 aa  42.4  0.009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>