64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_0926 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_0926  hypothetical protein  100 
 
 		 565 aa  1157    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0918  hypothetical protein  55.65 
 
 		 551 aa  638    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2914  phage protein  54.85 
 
 		 567 aa  627  1e-178  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000301579 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3470  phage protein  54.67 
 
 		 567 aa  627  1e-178  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000394685 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2779  phage protein  54.67 
 
 		 567 aa  625  1e-178  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00246067  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1032  hypothetical protein  35.9 
 
 		 543 aa  341  2e-92  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1049  hypothetical protein, putative phage gene  39.64 
 
 		 541 aa  331  2e-89  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5076  Gp5 domain-containing protein  38.79 
 
 		 323 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0680  Gp5 domain-containing protein  38.79 
 
 		 323 aa  199  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.736805  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0722  hypothetical protein  32.82 
 
 		 321 aa  171  2e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0564  hypothetical protein  31.9 
 
 		 364 aa  162  1e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.636902 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1446  Gp5 domain-containing protein  35.29 
 
 		 359 aa  155  2e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.760376  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2743  Gp5 domain-containing protein  35.29 
 
 		 359 aa  155  2e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.724798 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0263  Gp5 domain protein  39.43 
 
 		 360 aa  152  2e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.791542  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0742  hypothetical protein  40.33 
 
 		 229 aa  148  3e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.10229 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05049  hypothetical protein  38.39 
 
 		 232 aa  140  4.999999999999999e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1304  hypothetical protein  37.7 
 
 		 230 aa  140  7.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05048  hypothetical protein  36.07 
 
 		 229 aa  136  8e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0743  hypothetical protein  45.73 
 
 		 231 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.104766 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0565  hypothetical protein  32.55 
 
 		 230 aa  122  9.999999999999999e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.465028 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0721  hypothetical protein  31.14 
 
 		 225 aa  121  3.9999999999999996e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5075  hypothetical protein  36.76 
 
 		 230 aa  120  6e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0681  hypothetical protein  36.22 
 
 		 232 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0262  hypothetical protein  35.76 
 
 		 233 aa  115  3e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1447  hypothetical protein  34.48 
 
 		 228 aa  112  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.129718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2744  hypothetical protein  33.91 
 
 		 228 aa  109  1e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.950913  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4921  hypothetical protein  41.88 
 
 		 125 aa  99.4  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4920  hypothetical protein  30.27 
 
 		 197 aa  82  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1306  hypothetical protein  46.99 
 
 		 178 aa  79.7  0.0000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3024  Rhs element Vgr protein  25.09 
 
 		 725 aa  68.6  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.130505 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3654  baseplate assembly protein, putative  26.09 
 
 		 250 aa  54.7  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1305  hypothetical protein  53.85 
 
 		 58 aa  53.9  0.000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0169  hypothetical protein  22.43 
 
 		 741 aa  53.9  0.000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01160  hypothetical protein  22.22 
 
 		 741 aa  52.4  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.73633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3133  Rhs element Vgr protein  23.59 
 
 		 767 aa  52  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.054847  normal  0.114782 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3489  hypothetical protein  23.59 
 
 		 767 aa  51.6  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.159566  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2439  type VI secretion system Vgr family protein  27.51 
 
 		 712 aa  51.6  0.00004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4080  type VI secretion system Vgr family protein  21.65 
 
 		 771 aa  50.1  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000279673 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2332  Rhs element Vgr protein  23.38 
 
 		 741 aa  49.3  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00996193  normal  0.0126654 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50870  Rhs element Vgr protein  25.63 
 
 		 668 aa  48.9  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1191  Rhs element Vgr protein  27.57 
 
 		 703 aa  48.1  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_36  VgrG protein, VgrG-2  25.58 
 
 		 754 aa  48.1  0.0004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000448  VgrG protein  23.3 
 
 		 692 aa  47.8  0.0006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000107078  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0265  Rhs element Vgr protein  24.35 
 
 		 731 aa  47.8  0.0006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05870  hypothetical protein  24.27 
 
 		 692 aa  47.4  0.0007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1193  Rhs element Vgr protein  24.35 
 
 		 731 aa  47.4  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.598361  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0410  Rhs element Vgr protein  24.35 
 
 		 734 aa  47  0.0009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.447319  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1607  Rhs element Vgr protein  24.35 
 
 		 734 aa  47  0.0009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1790  Rhs element Vgr protein  24.35 
 
 		 734 aa  47  0.0009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.129982  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2953  Rhs element Vgr protein  24.35 
 
 		 734 aa  47  0.0009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.527761  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2828  Rhs element Vgr protein  24.35 
 
 		 734 aa  47  0.0009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0460  Rhs element Vgr protein  24.35 
 
 		 734 aa  47  0.0009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.141236  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4009  Rhs element Vgr protein  26.55 
 
 		 756 aa  45.4  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0849352  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3752  Rhs element Vgr protein  21.52 
 
 		 755 aa  45.1  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.617325 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6124  type VI secretion system Vgr family protein  22.86 
 
 		 714 aa  44.7  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.029227  normal  0.478766 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4429  Rhs element Vgr protein  24.02 
 
 		 724 aa  44.7  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3234  type VI secretion system Vgr family protein  24.73 
 
 		 722 aa  44.3  0.006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4483  type VI secretion system Vgr family protein  21.56 
 
 		 778 aa  44.3  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3389  baseplate assembly protein, putative  24.77 
 
 		 240 aa  44.3  0.006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3783  Rhs element Vgr protein  23 
 
 		 785 aa  43.9  0.007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.757692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0241  Rhs element Vgr protein  22.32 
 
 		 907 aa  44.3  0.007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2888  hypothetical protein  25.5 
 
 		 668 aa  43.9  0.008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.882104  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01965  hypothetical protein  22.47 
 
 		 771 aa  43.5  0.01  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0250  type VI secretion system Vgr family protein  24.31 
 
 		 794 aa  43.5  0.01  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>