More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene XfasM23_2263 on replicon NC_010579
Organism: Xylella fastidiosa M23



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010579  XfasM23_2263  single-strand binding protein  100 
 
 		 119 aa  248  2e-65  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.0000000257141  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4276  single-strand binding protein  62.83 
 
 		 112 aa  142  1e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  1.7148099999999997e-20  normal  0.751726 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6500  single-strand binding protein  61.95 
 
 		 113 aa  139  9.999999999999999e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000000000157974  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6592  single-strand binding protein  61.95 
 
 		 113 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000130329  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0044  single-strand binding protein  40.74 
 
 		 137 aa  95.1  3e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.139232  n/a   
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5424  single-strand binding protein  40.71 
 
 		 130 aa  91.7  3e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_5019  single-strand binding protein  40.71 
 
 		 130 aa  91.3  4e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0663797  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0422  single-stranded DNA-binding protein  39.45 
 
 		 178 aa  89  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.508741 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03705  single-stranded DNA-binding protein  43.56 
 
 		 178 aa  89.4  2e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0484  single-strand binding protein  39.17 
 
 		 176 aa  89.4  2e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000759205  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2815  single-stranded DNA-binding protein  43 
 
 		 177 aa  88.6  2e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002363  single-stranded DNA-binding protein  42.57 
 
 		 178 aa  88.2  3e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.298235  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0449  single-strand binding protein  38.26 
 
 		 143 aa  87.8  4e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000857397  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0691  single-strand binding protein  41.58 
 
 		 182 aa  87.8  5e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4518  single-stranded DNA-binding protein  38 
 
 		 183 aa  87  9e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.142427  normal  0.115011 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0066  single-stranded DNA-binding protein  39 
 
 		 150 aa  86.3  1e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0277  single-stranded DNA-binding protein  39.62 
 
 		 185 aa  86.7  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0107  single-strand binding protein  38.39 
 
 		 165 aa  86.3  1e-16  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0655467  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0304  single-stranded DNA-binding protein  39.62 
 
 		 185 aa  86.7  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.345717  normal  0.895882 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0461  single-stranded DNA-binding protein  40.59 
 
 		 183 aa  85.9  2e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4439  single-strand binding protein  40.59 
 
 		 181 aa  85.5  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.580245  normal  0.977465 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2184  single-strand binding protein  37.61 
 
 		 160 aa  85.5  2e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2293  single-strand binding protein  37.74 
 
 		 155 aa  85.5  2e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0749  single-stranded DNA-binding protein  40.2 
 
 		 182 aa  85.9  2e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0561709 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0056  single-stranded DNA-binding protein  39.39 
 
 		 175 aa  85.9  2e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.564154 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3850  single-stranded DNA-binding protein  40.2 
 
 		 182 aa  85.9  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3760  single-stranded DNA-binding protein  40.2 
 
 		 182 aa  85.9  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.637198  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0656  single-stranded DNA-binding protein  37 
 
 		 189 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5049  single-stranded DNA-binding protein  38 
 
 		 172 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.274707  normal  0.047816 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0723  single-strand binding protein  39.6 
 
 		 180 aa  85.1  3e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4105  single-strand binding protein  39.22 
 
 		 181 aa  85.1  3e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.512282  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3512  single-stranded DNA-binding protein  40.59 
 
 		 176 aa  84.3  4e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.534706  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3662  single-stranded DNA-binding protein  40.59 
 
 		 180 aa  84.3  5e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.311594  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1550  single-stranded DNA-binding protein  37.61 
 
 		 177 aa  84.3  5e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.202411  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5215  single-stranded DNA-binding protein  37.61 
 
 		 177 aa  84.3  5e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.656478  normal  0.693787 
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0002  single-stranded DNA-binding protein  35.54 
 
 		 175 aa  84.3  5e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3926  single-strand binding protein  35.51 
 
 		 156 aa  84  6e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3391  single-strand binding protein  31.58 
 
 		 222 aa  84  7e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3876  single-strand binding protein  38 
 
 		 162 aa  83.6  8e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.611448  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0485  single-stranded DNA-binding protein  36 
 
 		 181 aa  83.6  9e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0174674 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0421  single-strand binding protein (SSB) (helix-destabilizing protein)  34.21 
 
 		 159 aa  83.6  9e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0397  single-strand binding protein (SSB) (helix-destabilizing protein)  34.21 
 
 		 159 aa  83.6  9e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0518  single-stranded DNA-binding protein  36 
 
 		 181 aa  83.6  9e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.183562 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4718  single-stranded DNA-binding protein  35.64 
 
 		 183 aa  83.6  9e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.336644 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0514  single-stranded DNA-binding protein  36 
 
 		 181 aa  83.6  9e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1903  single-strand binding protein  37.84 
 
 		 151 aa  82.8  0.000000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4136  single-strand binding protein  33.93 
 
 		 165 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00257705  normal  0.135122 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1608  single-strand binding protein  38.18 
 
 		 151 aa  82.8  0.000000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.409638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1729  single-stranded DNA binding protein  37.61 
 
 		 149 aa  83.2  0.000000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0483  single-strand binding protein  37.27 
 
 		 156 aa  82  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0327  single-strand binding protein  36.54 
 
 		 201 aa  82  0.000000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00747942  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0325  single-strand binding protein  41.44 
 
 		 160 aa  82  0.000000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0051  single-stranded DNA-binding protein  38.38 
 
 		 175 aa  82.8  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.772758  normal  0.0108774 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3411  single-strand binding protein  37.04 
 
 		 146 aa  81.6  0.000000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0370  single-stranded DNA-binding protein  38.32 
 
 		 158 aa  81.6  0.000000000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  4.28253e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1823  single-strand DNA binding protein  38.32 
 
 		 158 aa  81.6  0.000000000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.0000000500943  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03931  single-strand DNA-binding protein  38.61 
 
 		 178 aa  81.6  0.000000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0479609  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3933  single-strand binding protein  38.61 
 
 		 178 aa  81.6  0.000000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4573  single-stranded DNA-binding protein  38.24 
 
 		 171 aa  81.3  0.000000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5562  single-stranded DNA-binding protein  38.61 
 
 		 178 aa  81.6  0.000000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.214992  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3968  single-stranded DNA-binding protein  38.61 
 
 		 178 aa  81.6  0.000000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0530108 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2424  single-strand binding protein  39.25 
 
 		 167 aa  81.3  0.000000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00208547  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4521  single-stranded DNA-binding protein  38.61 
 
 		 178 aa  81.6  0.000000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4611  single-stranded DNA-binding protein  38.61 
 
 		 178 aa  81.6  0.000000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03891  hypothetical protein  38.61 
 
 		 178 aa  81.6  0.000000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0417311  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4301  single-stranded DNA-binding protein  38.61 
 
 		 178 aa  81.6  0.000000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0312  single-strand binding protein  37.62 
 
 		 168 aa  80.9  0.000000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000035276 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4650  single-stranded DNA-binding protein  38.78 
 
 		 176 aa  80.9  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4512  single-stranded DNA-binding protein  38.78 
 
 		 176 aa  80.9  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0438  single-strand binding protein  38.74 
 
 		 157 aa  80.9  0.000000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.367584 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0362  single-strand binding protein  40.19 
 
 		 147 aa  81.3  0.000000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000141012  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4599  single-stranded DNA-binding protein  38.78 
 
 		 176 aa  80.9  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4598  single-stranded DNA-binding protein  38.78 
 
 		 176 aa  80.9  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.454444  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4504  single-stranded DNA-binding protein  38.78 
 
 		 176 aa  80.9  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.580839  normal  0.345309 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0351  single-stranded DNA-binding protein  36.45 
 
 		 169 aa  80.9  0.000000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0967385  normal  0.582722 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1569  single-strand binding protein  37.61 
 
 		 164 aa  80.5  0.000000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.285989  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0262  single-stranded DNA-binding protein  37.62 
 
 		 176 aa  80.5  0.000000000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2746  single-strand binding protein  36.36 
 
 		 154 aa  80.5  0.000000000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2227  single-strand binding protein  39.64 
 
 		 152 aa  80.1  0.000000000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.261214  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3117  single-strand binding protein  39.25 
 
 		 146 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3865  single-strand binding protein  33.64 
 
 		 161 aa  79.7  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.672811  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3023  single-strand binding protein  33.33 
 
 		 163 aa  79.7  0.00000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.208974  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0868  single-stranded DNA-binding protein  34.17 
 
 		 165 aa  79.3  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.949427  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3808  single-strand binding protein  33.64 
 
 		 163 aa  79.7  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.39281  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3951  single-strand binding protein  33.64 
 
 		 161 aa  79.7  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.290115  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3307  single-strand binding protein  35.45 
 
 		 167 aa  79.7  0.00000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.358097  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0148  single-strand binding protein  37.38 
 
 		 200 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000650066  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1129  single-stranded DNA-binding protein  36.36 
 
 		 154 aa  79.7  0.00000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0688352  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0533  single-strand binding protein  38.61 
 
 		 236 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0176705  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09200  single-stranded DNA-binding protein  34.17 
 
 		 165 aa  79.3  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0140345  normal  0.797582 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0516  single-strand binding protein  37.62 
 
 		 234 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.490928  normal  0.543357 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4713  single-strand binding protein  38.18 
 
 		 187 aa  80.1  0.00000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0930  single-strand binding protein  37 
 
 		 233 aa  78.6  0.00000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2626  single-strand binding protein  34.23 
 
 		 176 aa  79.3  0.00000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.377428  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0640  single-strand binding protein  38.61 
 
 		 236 aa  78.6  0.00000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.021198  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0643  ssDNA-binding protein  40.74 
 
 		 157 aa  79.3  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.25623e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00235  single-strand binding protein  36.45 
 
 		 196 aa  79  0.00000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.508026  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03473  hypothetical protein  39 
 
 		 161 aa  79  0.00000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.953641  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4565  single-strand binding protein  37.27 
 
 		 162 aa  79  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.111222 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0817  single-strand binding protein  37.84 
 
 		 188 aa  79.3  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.517323  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>