237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_R0061 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_R0061  tRNA-Phe  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.686895  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01870  tRNA-Phe  92 
 
 		 76 bp  101  2e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1399  tRNA-Phe  91.89 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.756645 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25110  tRNA-Phe  89.33 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0050  tRNA-Phe  89.33 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.849322 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0007  tRNA-Phe  89.33 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00110139 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0008  tRNA-Phe  89.33 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0055  tRNA-Phe  89.33 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00022808  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34030  tRNA-Phe  89.04 
 
 		 73 bp  81.8  0.00000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.76483  normal  0.54682 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0075  tRNA-Phe  88 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.532419 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0054  tRNA-Phe  92.16 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.579409  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21210  tRNA-Met  92.45 
 
 		 74 bp  65.9  0.000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0048  tRNA-Phe  97.22 
 
 		 73 bp  63.9  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0055  tRNA-Met  90.74 
 
 		 74 bp  60  0.00000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0104012 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0055  tRNA-Phe  88.89 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.527907 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0008  tRNA-Met  90.74 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0008  tRNA-Met  90.74 
 
 		 74 bp  60  0.00000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.143037  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0057  tRNA-Met  90.74 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0200182  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0007  tRNA-Met  90.74 
 
 		 74 bp  60  0.00000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0007  tRNA-Met  90.74 
 
 		 74 bp  60  0.00000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17540  tRNA-Met  90.57 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.164886  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0056  tRNA-Phe  88.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.339254  normal  0.385258 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0022  tRNA-Ile  93.18 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Ile-1  tRNA-Ile  93.18 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Ile-2  tRNA-Ile  93.18 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.226079  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0012  tRNA-Ile  93.18 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0130258  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0045  tRNA-Ile  93.18 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.339043  hitchhiker  0.000000161581 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0006  tRNA-Ile  93.18 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0009  tRNA-Ile  91.49 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.425741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0004  tRNA-Ile  91.49 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000939428  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0002  tRNA-Ile  91.49 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000539151  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0004  tRNA-Ile  91.49 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000076362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t03  tRNA-Ile  91.49 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0024  tRNA-Ile  91.49 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0004  tRNA-Ile  91.49 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.147077  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0004  tRNA-Ile  91.49 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00301418 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0009  tRNA-Ile  91.49 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0767985  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0047  tRNA-Ile  91.49 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.026073  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0052  tRNA-Ile  91.49 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0029428  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0004  tRNA-Ile  91.49 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0009  tRNA-Ile  91.49 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00618734  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0015  tRNA-Met  88.89 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.099209  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0028  tRNA-Phe  94.12 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06160  tRNA-Phe  94.12 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.599114  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0012  tRNA-Ile  92.86 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000191941  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0043  tRNA-Ile  92.86 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.213128  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0011  tRNA-Met  88.89 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.519438 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0053  tRNA-Met  88.89 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006681  CNL04000  tRNA-Phe  96.55 
 
 		 88 bp  50.1  0.00007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.235212  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND00230  tRNA-Phe  96.55 
 
 		 88 bp  50.1  0.00007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.130678  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND00330  tRNA-Phe  96.55 
 
 		 88 bp  50.1  0.00007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0904206  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE01890  tRNA-Phe  96.55 
 
 		 90 bp  50.1  0.00007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.225385  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE03690  tRNA-Phe  96.55 
 
 		 92 bp  50.1  0.00007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.805719  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0011  tRNA-Met  91.11 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00653203  hitchhiker  0.000515394 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0057  tRNA-Ile  91.11 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0062  tRNA-Ile  91.11 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0073  tRNA-Ile  91.11 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.596138  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0019  tRNA-Ile  91.11 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0047  tRNA-Ile  91.11 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.930435  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0072  tRNA-Ile  91.11 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0035  tRNA-Phe  100 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0179  tRNA-Phe  100 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0628271  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0016  tRNA-Ile  91.11 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0679005  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_R13  tRNA-Phe  100 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0034  tRNA-Ile  91.11 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.209453  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0029  tRNA-Ile  91.11 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0019  tRNA-Ile  91.11 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.191649  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0010  tRNA-Ile  90.91 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.448229  hitchhiker  0.009241 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0004  tRNA-Phe  93.75 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000467453  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0208  tRNA-Phe  91.67 
 
 		 78 bp  48.1  0.0003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_R0060  tRNA-Phe  90 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.456959  normal  0.0307991 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0385  tRNA-Ile  90.91 
 
 		 79 bp  48.1  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.900506  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0004  tRNA-Phe  91.67 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.250766  normal  0.359385 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3083  tRNA-Ile  90.91 
 
 		 79 bp  48.1  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0051  tRNA-Ile  90.91 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.094292  normal  0.53316 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0022  tRNA-Ile  90.91 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00808191  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0033  tRNA-Ile  90.91 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0776982  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0053  tRNA-Ile  90.91 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00143998  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0063  tRNA-Ile  90.91 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0802008  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0207  tRNA-Phe  91.67 
 
 		 78 bp  48.1  0.0003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0037  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0006    91.43 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0548782  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0056  tRNA-Phe  91.43 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0031  tRNA-Phe  91.43 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0051  tRNA-Ile  90.7 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0056  tRNA-Ile  90.7 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.239639  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0014  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.288772  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0056  tRNA-Phe  91.43 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.155736 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0067  tRNA-Phe  91.43 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.687392  normal  0.586478 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1166  tRNA-Ile  89.74 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0042  tRNA-Phe  91.43 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0071  tRNA-Phe  91.43 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0756979 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0006  tRNA-Phe  91.43 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0034  tRNA-Phe  91.43 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.326122  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0049  tRNA-Met  90.7 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0228111 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0051  tRNA-Phe  91.43 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.271355  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0014  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_R23  tRNA-Ile  90.7 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.105438  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0043  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0019  tRNA-Phe  91.43 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>