More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_3033 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_3033  YceI family protein  100 
 
 
224 aa  451  1.0000000000000001e-126  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2885  YceI family protein  53.46 
 
 
229 aa  231  5e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.265419  normal  0.0897618 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0195  YceI family protein  48.57 
 
 
187 aa  191  1e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0122  YceI family protein  47.44 
 
 
187 aa  189  2e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.409556  normal 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4591  YceI family protein  38.61 
 
 
190 aa  142  3e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2101  YceI family protein  38.6 
 
 
219 aa  141  9e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.957341  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7029  YceI family protein  38.66 
 
 
183 aa  139  3e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.244841 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3093  YceI family protein  39.9 
 
 
182 aa  139  4.999999999999999e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1086  hypothetical protein  39.8 
 
 
181 aa  139  4.999999999999999e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0872  YceI family protein  36.5 
 
 
180 aa  136  2e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.467624  normal  0.0780201 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2815  YceI family protein  40.61 
 
 
175 aa  135  6.0000000000000005e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2458  YceI family protein  38.14 
 
 
187 aa  134  9.999999999999999e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00319405  normal  0.0447487 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3757  YceI family protein  37 
 
 
181 aa  134  9.999999999999999e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1869  YceI family protein  40.45 
 
 
189 aa  134  9.999999999999999e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.155995  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1565  YceI family protein  39 
 
 
182 aa  133  1.9999999999999998e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2880  YceI family protein  37 
 
 
181 aa  133  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3294  YceI family protein  38.38 
 
 
182 aa  132  3e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0530  YceI family protein  39.9 
 
 
186 aa  132  5e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.456104  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24290  hypothetical protein  40.4 
 
 
176 aa  132  5e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0570577  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00890  hypothetical protein  36.68 
 
 
183 aa  130  2.0000000000000002e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25500  hypothetical protein  39.9 
 
 
181 aa  130  2.0000000000000002e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1722  YceI family protein  37.5 
 
 
183 aa  129  3e-29  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4326  YceI family protein  40.4 
 
 
187 aa  129  5.0000000000000004e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.113695  normal  0.313074 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0861  YceI family protein  37.44 
 
 
177 aa  127  9.000000000000001e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.47771  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3192  YceI family protein  37.93 
 
 
182 aa  127  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1467  YceI family protein  35.5 
 
 
175 aa  126  3e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000602513  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3257  YceI family protein  37.56 
 
 
178 aa  125  5e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0987348  normal  0.178917 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4425  YceI family protein  38.89 
 
 
188 aa  125  6e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2233  YceI family protein  35.92 
 
 
199 aa  124  1e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.329585  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4605  YceI family protein  39.11 
 
 
196 aa  123  2e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.534592  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0676  hypothetical protein  35.29 
 
 
174 aa  123  3e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0885359  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3638  YceI family protein  35.27 
 
 
214 aa  122  5e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.159017 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1092  YceI family protein  36.13 
 
 
195 aa  122  6e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00011726  normal  0.0389048 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4589  YceI  36.5 
 
 
186 aa  121  7e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000628693  normal  0.988938 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3639  YceI family protein  36.73 
 
 
182 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.162528 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4751  YceI family protein  35.32 
 
 
182 aa  119  3e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0932  YceI  37.31 
 
 
183 aa  119  4.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.656064  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0089  YceI family protein  36.6 
 
 
184 aa  118  7.999999999999999e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3307  YceI family protein  34.98 
 
 
182 aa  117  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.872006  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1264  YceI family protein  35.35 
 
 
185 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.556234  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0992  YceI family protein  35.47 
 
 
183 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00460227  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1870  YceI family protein  36.32 
 
 
182 aa  116  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0076574  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1281  YceI family protein  35.35 
 
 
184 aa  115  5e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0989  YceI family protein  35.47 
 
 
183 aa  115  5e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.324604  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4058  YceI family protein  35.47 
 
 
176 aa  115  5e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.675999  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0518  YceI family protein  36.08 
 
 
181 aa  115  6e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000000120674  hitchhiker  0.000476131 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8737  YceI  34.69 
 
 
194 aa  114  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1733  YceI family protein  33.99 
 
 
177 aa  113  2.0000000000000002e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1312  YceI family protein  36.87 
 
 
201 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000260413 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1456  hypothetical protein  36.22 
 
 
223 aa  112  6e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2493  YceI family protein  36.73 
 
 
201 aa  111  7.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2208  YceI  38.46 
 
 
212 aa  111  7.000000000000001e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0100235  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2271  YceI family protein  35 
 
 
180 aa  111  8.000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07170  hypothetical protein  36.19 
 
 
181 aa  110  1.0000000000000001e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.155954 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14930  hypothetical protein  35.64 
 
 
182 aa  111  1.0000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2406  YceI family protein  35.71 
 
 
201 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.213502  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4031  YceI  31.19 
 
 
182 aa  109  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.269923  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2913  YceI family protein  34.45 
 
 
201 aa  109  4.0000000000000004e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4106  YceI family protein  31.19 
 
 
182 aa  109  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4261  YceI family protein  31.19 
 
 
182 aa  109  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.651401  normal  0.0270494 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0607  YceI family protein  34.03 
 
 
178 aa  108  7.000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.372987 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3514  YceI family protein  35.03 
 
 
285 aa  108  7.000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3940  YceI family protein  34.34 
 
 
200 aa  108  9.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0411323 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1199  YceI family protein  34.36 
 
 
183 aa  107  1e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.144393  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0092  YceI family protein  33.68 
 
 
209 aa  107  1e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.441505  normal  0.027185 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3449  YceI  32.66 
 
 
196 aa  107  2e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1207  YceI family protein  33.65 
 
 
197 aa  107  2e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00184458  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3701  YceI  34.26 
 
 
187 aa  106  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.634464  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3001  YceI family protein  33.5 
 
 
195 aa  107  2e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000127378  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3066  YceI family protein  33.65 
 
 
197 aa  107  2e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0262369 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2933  YceI family protein  31.43 
 
 
182 aa  106  3e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.258273 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4627  YceI family protein  33.51 
 
 
175 aa  105  4e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0878  YceI family protein  31.47 
 
 
182 aa  105  5e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2169  YceI family protein  32.87 
 
 
181 aa  103  1e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0221884 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2032  YceI  31.61 
 
 
192 aa  104  1e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.267829  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2737  YceI family protein  35.23 
 
 
181 aa  104  1e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0292655  normal  0.091865 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2371  YceI family protein  34.5 
 
 
198 aa  103  2e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2307  YceI family protein  35.64 
 
 
204 aa  103  2e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000000152609  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4531  YceI family protein  32.16 
 
 
181 aa  103  2e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.642699  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0441  YceI family protein  33.68 
 
 
183 aa  102  4e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.886129  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2711  hypothetical protein  32.67 
 
 
171 aa  102  5e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.440921  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7583  YceI-like family protein  35.2 
 
 
202 aa  102  5e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.94246  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2768  hypothetical protein  32.67 
 
 
171 aa  102  5e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000157098  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2314  hypothetical protein  30.3 
 
 
171 aa  101  7e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.613001  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1380  YceI family protein  32.02 
 
 
187 aa  100  3e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.181422  normal  0.385301 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3889  YceI family protein  31.82 
 
 
201 aa  97.8  1e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0543172  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3656  YceI family protein  30.46 
 
 
180 aa  97.1  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0464334  normal  0.0393691 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4409  YceI family protein  30.57 
 
 
177 aa  95.9  4e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1711  YceI family protein  30.3 
 
 
188 aa  95.5  6e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3967  YceI family protein  31.82 
 
 
201 aa  94.4  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2505  YceI family protein  28.87 
 
 
179 aa  94.4  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0958427 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0268  hypothetical protein  33.49 
 
 
232 aa  93.6  2e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0333  YceI family protein  33 
 
 
199 aa  93.6  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.192845  normal  0.888817 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0382  YceI family protein  27.27 
 
 
175 aa  93.2  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.350696 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3826  YceI  30.5 
 
 
201 aa  93.2  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3326  YceI family protein  28.57 
 
 
190 aa  92.4  5e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000103156 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2685  YceI family protein  29.85 
 
 
174 aa  90.1  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1457  YceI family protein  30.32 
 
 
177 aa  89  5e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.83368  normal  0.522042 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2435  YceI family protein  32.5 
 
 
188 aa  87.8  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.832405  normal  0.0582212 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1334  YceI  29.59 
 
 
189 aa  87.8  1e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000025527  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>