26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_0945 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_0945  pentapeptide repeat protein  100 
 
 
264 aa  514  1.0000000000000001e-145  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2675  pentapeptide repeat-containing protein  50.61 
 
 
250 aa  187  1e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.33412  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1041  pentapeptide repeat-containing protein  45.04 
 
 
265 aa  184  1.0000000000000001e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3823  pentapeptide repeat protein  44.27 
 
 
254 aa  179  4.999999999999999e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.199719  normal  0.0347073 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2076  pentapeptide repeat-containing protein  45.63 
 
 
266 aa  178  8e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0171382  normal  0.301394 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3732  pentapeptide repeat-containing protein  44.91 
 
 
257 aa  178  1e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.612833  normal  0.0137169 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5585  pentapeptide repeat protein  41.34 
 
 
258 aa  147  2.0000000000000003e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3680  pentapeptide repeat protein  35.29 
 
 
266 aa  131  1.0000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0611357  normal  0.412611 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4160  pentapeptide repeat-containing protein  38.04 
 
 
266 aa  128  8.000000000000001e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09851  hypothetical protein  43.4 
 
 
169 aa  50.4  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.176778 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2179  putative outer membrane adhesin like proteiin  52.08 
 
 
14916 aa  47.4  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2288  pentapeptide repeat protein  46.55 
 
 
277 aa  47  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00748476  unclonable  0.0000000000682389 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08061  hypothetical protein  39.62 
 
 
170 aa  46.6  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1728  pentapeptide repeat-containing protein  44.9 
 
 
389 aa  46.6  0.0004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.952308  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0183  pentapeptide repeat-containing protein  39.62 
 
 
170 aa  45.8  0.0008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08151  hypothetical protein  39.62 
 
 
170 aa  45.8  0.0008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0290  pentapeptide repeat-containing protein  42.59 
 
 
182 aa  45.4  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.560216  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4156  pentapeptide repeat protein  34 
 
 
261 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4196  pentapeptide repeat protein  34 
 
 
261 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.666213  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0301  pentapeptide repeat-containing protein  36.04 
 
 
263 aa  43.5  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0195  hypothetical protein  36.76 
 
 
142 aa  43.5  0.004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.673966 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4849  pentapeptide repeat-containing protein  41.67 
 
 
973 aa  42.7  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.692365  normal  0.0232391 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2141  pentapeptide repeat-containing protein  47.17 
 
 
222 aa  42.7  0.006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4278  pentapeptide repeat-containing protein  43.75 
 
 
411 aa  42.4  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0535647  normal  0.226875 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6057  pentapeptide repeat protein  35.29 
 
 
126 aa  42.4  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.965316  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1024  pentapeptide repeat-containing protein  42.55 
 
 
389 aa  42  0.01  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.299453  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>