More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_0435 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_0435  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
287 aa  554  1e-157  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.356864  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3280  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  69.83 
 
 
286 aa  338  4e-92  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1556  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  66.38 
 
 
301 aa  321  8e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6406  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  64.75 
 
 
296 aa  298  7e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.131227  normal  0.392308 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3780  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  60.16 
 
 
282 aa  298  8e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4519  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  63 
 
 
299 aa  297  1e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.732123 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2979  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.54 
 
 
296 aa  274  1.0000000000000001e-72  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0423  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.12 
 
 
297 aa  251  8.000000000000001e-66  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.283538  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4108  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.8 
 
 
283 aa  246  4e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29400  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, permease component  53.02 
 
 
285 aa  238  5.999999999999999e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.559964  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0464  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.71 
 
 
273 aa  228  8e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5005  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.13 
 
 
289 aa  228  1e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21600  aliphatic sulfonates ABC transporter, inner membrane component  49.37 
 
 
284 aa  219  5e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1380  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  49.36 
 
 
277 aa  218  1e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.153307 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3598  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  49.56 
 
 
285 aa  216  4e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.330128 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3818  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.41 
 
 
280 aa  213  2.9999999999999995e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.615395  normal  0.42897 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1796  sulfonate ABC transporter, permease protein, putative  49.12 
 
 
285 aa  212  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0250  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.64 
 
 
280 aa  207  1e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0722  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.58 
 
 
272 aa  203  2e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0102858  normal  0.0961586 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0239  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.44 
 
 
265 aa  201  9e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00756787 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4973  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.02 
 
 
265 aa  201  9e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0722896  normal  0.022026 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0254  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.44 
 
 
265 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.293544  normal  0.0445843 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2882  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.98 
 
 
268 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.80309  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4420  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.48 
 
 
279 aa  200  1.9999999999999998e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.25857  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0981  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  45.98 
 
 
279 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0263  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.21 
 
 
265 aa  200  3e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.791848  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2511  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.01 
 
 
266 aa  198  7e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3400  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.72 
 
 
275 aa  197  1.0000000000000001e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1736  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.86 
 
 
264 aa  197  2.0000000000000003e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.440066  normal  0.144233 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5412  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  42.74 
 
 
260 aa  196  3e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.210037  hitchhiker  0.00191971 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1210  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.86 
 
 
315 aa  196  4.0000000000000005e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1453  alkanesulfonate transporter permease subunit  43.78 
 
 
263 aa  196  4.0000000000000005e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0423  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.68 
 
 
264 aa  196  5.000000000000001e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2638  ABC sulfonate transporter, inner membrane subunit  44.21 
 
 
279 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0950643  hitchhiker  0.0000361652 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0355  putative ABC aliphatic sulfonates transporter, permease subunit  42.68 
 
 
264 aa  196  5.000000000000001e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0030  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.06 
 
 
264 aa  194  2e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.050552  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2657  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.78 
 
 
269 aa  194  2e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.363458 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3299  putative sulfonate ABC transporter, permease protein  44.68 
 
 
286 aa  193  2e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.201269  normal  0.262094 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1684  ABC transporter permease  41.88 
 
 
262 aa  192  5e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19570  ABC transporter permease  41.45 
 
 
262 aa  192  8e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3464  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.19 
 
 
294 aa  191  1e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.136656  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0024  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.63 
 
 
264 aa  191  1e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2787  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.82 
 
 
272 aa  190  2e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.334714  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1083  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.1 
 
 
270 aa  189  4e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1563  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.1 
 
 
270 aa  189  4e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1539  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.1 
 
 
270 aa  189  5e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0890555  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1464  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.68 
 
 
270 aa  187  1e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0183453  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1669  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.1 
 
 
273 aa  187  2e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.5369  normal  0.169212 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1867  ABC transporter permease  41.42 
 
 
272 aa  187  2e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4139  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  41.7 
 
 
275 aa  186  3e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000314222  normal  0.0106036 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2622  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.04 
 
 
289 aa  186  3e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.753313  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2583  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.04 
 
 
289 aa  186  3e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2628  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.04 
 
 
289 aa  186  3e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.128032  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4705  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  43.1 
 
 
270 aa  186  4e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1485  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.26 
 
 
270 aa  186  5e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1998  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.69 
 
 
283 aa  185  6e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.894639  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4338  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.83 
 
 
311 aa  185  8e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.840444  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5130  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.79 
 
 
272 aa  185  8e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.612608  normal  0.0470724 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1673  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.74 
 
 
263 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3159  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.6 
 
 
293 aa  184  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3478  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.35 
 
 
291 aa  184  1.0000000000000001e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.466071  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5315  aliphatic sulfonates ABC transporter, permease protein  42.31 
 
 
265 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5516  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.1 
 
 
262 aa  183  3e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0683  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  39.75 
 
 
268 aa  182  4.0000000000000006e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.473028  normal  0.58692 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2304  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.49 
 
 
278 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.37818 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4875  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  41.88 
 
 
265 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.746085  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1374  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.64 
 
 
287 aa  182  6e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.944096  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1385  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.49 
 
 
284 aa  181  1e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0616622  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1642  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.91 
 
 
263 aa  181  2e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2500  aliphatic sulfonate ABC transporter, permease protein  42.86 
 
 
268 aa  181  2e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3413  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.69 
 
 
271 aa  180  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0409101  normal  0.884011 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0765  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.7 
 
 
265 aa  179  4e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1837  aliphatic sulfonates ABC transporter, permease protein  44.21 
 
 
269 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.669476  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1822  aliphatic sulfonates ABC transporter, permease protein  44.64 
 
 
269 aa  178  7e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2492  ABC aliphatic sulfonates transporter, innermembrane subunit  42.86 
 
 
280 aa  178  1e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.773133 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4321  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.06 
 
 
264 aa  178  1e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.154719 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0381  aliphatic sulfonate ABC transporter, permease protein  43.97 
 
 
273 aa  177  2e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.410212  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1238  aliphatic sulfonate ABC transporter, permease protein  43.97 
 
 
273 aa  177  2e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.466833  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1990  aliphatic sulfonates ABC transporter, permease protein  43.97 
 
 
273 aa  177  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.088895  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0780  aliphatic sulfonate ABC transporter, permease protein  43.97 
 
 
273 aa  177  2e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.175921  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1724  aliphatic sulfonate ABC transporter, permease protein  43.97 
 
 
273 aa  177  2e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1648  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.92 
 
 
283 aa  176  4e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.189471  normal  0.0804385 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3406  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.45 
 
 
286 aa  175  6e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.316546  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1338  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.7 
 
 
260 aa  175  8e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.011116 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3715  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.45 
 
 
282 aa  175  8e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0101223 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1745  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.44 
 
 
280 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3599  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.03 
 
 
292 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0649453  normal  0.129383 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0772  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.24 
 
 
302 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0528102 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30490  aliphatic sulfonate ABC transporter permease protein  41.88 
 
 
264 aa  172  3.9999999999999995e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.168678  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2712  sulfonate ABC transporter permease  36.68 
 
 
282 aa  172  5e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2621  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.61 
 
 
281 aa  172  5e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000218671  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2920  sulfonate ABC transporter permease protein  36.68 
 
 
282 aa  172  5e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1372  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.35 
 
 
268 aa  172  7.999999999999999e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1043  alkanesulfonate transporter permease subunit  43.91 
 
 
263 aa  171  1e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00938  alkanesulfonate transporter subunit  43.91 
 
 
263 aa  171  1e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.028081  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2709  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.91 
 
 
263 aa  171  1e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.753275  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00945  hypothetical protein  43.91 
 
 
263 aa  171  1e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0322362  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2662  alkanesulfonate transporter permease subunit  43.91 
 
 
263 aa  171  1e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.629834  normal  0.0100847 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3872  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.22 
 
 
308 aa  171  1e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0743241  normal  0.0892137 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1036  alkanesulfonate transporter permease subunit  43.91 
 
 
263 aa  171  1e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0685931  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>