31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_4017 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_4017  hypothetical protein  100 
 
 
207 aa  416  9.999999999999999e-116  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0739843 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0579  hypothetical protein  63.78 
 
 
185 aa  239  2.9999999999999997e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.336002  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3529  hypothetical protein  51.43 
 
 
176 aa  156  2e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.452767  normal  0.831541 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1206  hypothetical protein  51.43 
 
 
176 aa  156  2e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0712  hypothetical protein  48.53 
 
 
205 aa  156  2e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.583463  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3838  hypothetical protein  49.66 
 
 
163 aa  123  2e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0788301  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0525  hypothetical protein  42.68 
 
 
174 aa  117  9.999999999999999e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3174  hypothetical protein  53.91 
 
 
150 aa  115  3.9999999999999997e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2866  hypothetical protein  36.68 
 
 
237 aa  100  2e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.794239  normal  0.0242431 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3074  hypothetical protein  41.96 
 
 
177 aa  92.8  3e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.426221  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2247  hypothetical protein  34.67 
 
 
248 aa  92.4  4e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3815  hypothetical protein  43.09 
 
 
124 aa  89.7  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.757001 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1514  hypothetical protein  41.07 
 
 
131 aa  84  0.000000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.338897 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3345  hypothetical protein  39.2 
 
 
173 aa  83.2  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.126619  normal  0.961104 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3182  hypothetical protein  39.85 
 
 
167 aa  82.4  0.000000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00860952  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0761  hypothetical protein  45.95 
 
 
169 aa  81.6  0.000000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.900094 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3017  hypothetical protein  45.54 
 
 
177 aa  80.1  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3911  hypothetical protein  32.07 
 
 
192 aa  79.3  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1487  hypothetical protein  35.12 
 
 
211 aa  78.2  0.00000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2796  hypothetical protein  30.81 
 
 
203 aa  72.8  0.000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.232161  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0127  hypothetical protein  39.5 
 
 
149 aa  71.2  0.000000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.488443  normal  0.651433 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3365  hypothetical protein  38.39 
 
 
124 aa  65.9  0.0000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.828629  normal  0.105235 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7729  hypothetical protein  58.82 
 
 
62 aa  63.2  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0250143  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7429  hypothetical protein  34.75 
 
 
185 aa  61.6  0.000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0751032 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3067  hypothetical protein  61.7 
 
 
58 aa  60.5  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.205429 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1036  hypothetical protein  35.14 
 
 
138 aa  58.2  0.00000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.128051  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3681  hypothetical protein  29.48 
 
 
258 aa  55.1  0.0000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3560  hypothetical protein  36.04 
 
 
148 aa  55.1  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2339  hypothetical protein  28.78 
 
 
148 aa  51.6  0.000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1810  hypothetical protein  40.3 
 
 
261 aa  45.8  0.0005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.187733  normal  0.988109 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0983  hypothetical protein  25.52 
 
 
173 aa  41.2  0.01  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0672895  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>