35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_3194 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_3194  hypothetical protein  100 
 
 		 373 aa  728    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.967593  normal  0.475895 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0641  hypothetical protein  28.49 
 
 		 358 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0333  hypothetical protein  27.22 
 
 		 374 aa  96.3  8e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3527  putative signal peptide protein  28.83 
 
 		 377 aa  94.7  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.793517  normal  0.789193 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1370  hypothetical protein  26.63 
 
 		 338 aa  92  2e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.378457 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2203  hypothetical protein  27.3 
 
 		 342 aa  89.4  9e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.54755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0565  hypothetical protein  29.89 
 
 		 338 aa  82.4  0.00000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0909  hypothetical protein  26.71 
 
 		 354 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3024  periplasmic lipoprotein-like protein  29.37 
 
 		 332 aa  78.6  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00846426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0195  putative signal peptide protein  29.18 
 
 		 329 aa  78.6  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.533491  normal  0.303405 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2835  periplasmic lipoprotein  24.24 
 
 		 344 aa  77.4  0.0000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.962002  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0948  periplasmic lipoprotein-like protein  26.71 
 
 		 354 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02712  hypothetical protein  25.23 
 
 		 345 aa  77.8  0.0000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0977  lipoprotein  25.83 
 
 		 354 aa  77.4  0.0000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00313194 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3297  periplasmic lipoprotein-like protein  24.21 
 
 		 353 aa  77.4  0.0000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1544  signal peptide protein  28.79 
 
 		 329 aa  77  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37860  hypothetical protein  24.25 
 
 		 354 aa  74.7  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.214112  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4477  lipoprotein  26.25 
 
 		 354 aa  72.8  0.000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.24024  normal  0.364663 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4064  putative lipoprotein  25.23 
 
 		 354 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.82498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003125  iron-regulated protein A precursor  24.46 
 
 		 345 aa  71.6  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.392653  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4576  hypothetical protein  26.02 
 
 		 366 aa  71.2  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0477994 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4368  lipoprotein, putative  24.62 
 
 		 354 aa  70.5  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2084  hypothetical protein  30.49 
 
 		 387 aa  70.1  0.00000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.868997 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4941  putative lipoprotein  24.26 
 
 		 354 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56850  putative lipoprotein  23.24 
 
 		 354 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1802  hypothetical protein  29.71 
 
 		 389 aa  68.6  0.0000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1784  putative lipoprotein  22.33 
 
 		 339 aa  67.8  0.0000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.327643  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4313  hypothetical protein  24.83 
 
 		 366 aa  67.8  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2559  periplasmic lipoprotein-like protein  22.29 
 
 		 352 aa  67  0.0000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0351138  hitchhiker  0.00000000167803 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4490  putative lipoprotein  23.95 
 
 		 354 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.020416 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3870  Peptidase M75, Imelysin  25.21 
 
 		 391 aa  64.3  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.755425  normal  0.516703 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0885  putative lipoprotein  22.86 
 
 		 335 aa  59.7  0.00000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.584322  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2143  periplasmic lipoprotein-like protein  25.07 
 
 		 380 aa  59.3  0.00000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0403933 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4530  Peptidase M75, Imelysin  26.99 
 
 		 384 aa  48.9  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.674322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2563  periplasmic lipoprotein-like protein  25.57 
 
 		 369 aa  48.1  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.440484  hitchhiker  0.00108015 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>