34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_2800 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_2800  hypothetical protein  100 
 
 
132 aa  259  1e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.176742  normal  0.880482 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4195  protein of unknown function DUF971  47.3 
 
 
121 aa  78.2  0.00000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.567549 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1476  hypothetical protein  54.55 
 
 
106 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.763244 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6148  hypothetical protein  34.59 
 
 
125 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4090  hypothetical protein  54.29 
 
 
97 aa  65.1  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0542229  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4202  protein of unknown function DUF971  54.29 
 
 
97 aa  65.1  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3352  hypothetical protein  38.61 
 
 
107 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3677  protein of unknown function DUF971  38.61 
 
 
107 aa  58.2  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.433959  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1292  hypothetical protein  50.79 
 
 
107 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.952815  normal  0.316279 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4192  protein of unknown function DUF971  39.42 
 
 
99 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34940  hypothetical protein  49.12 
 
 
93 aa  57  0.00000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000878957  normal  0.981288 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4885  hypothetical protein  40.79 
 
 
113 aa  55.1  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.624413 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0211  hypothetical protein  41.18 
 
 
93 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.191021 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2002  hypothetical protein  47.54 
 
 
92 aa  51.6  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3157  hypothetical protein  39.51 
 
 
116 aa  50.8  0.000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1963  hypothetical protein  44.62 
 
 
106 aa  50.4  0.000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.64349  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5007  hypothetical protein  40.3 
 
 
99 aa  50.4  0.000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1978  hypothetical protein  45.9 
 
 
92 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.370192  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6099  hypothetical protein  45.9 
 
 
92 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1890  hypothetical protein  44.62 
 
 
106 aa  49.7  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.834244  normal  0.853534 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5290  hypothetical protein  34.94 
 
 
95 aa  45.4  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.815643  normal  0.0611065 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6713  protein of unknown function DUF971  28.71 
 
 
124 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.919555  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0679  hypothetical protein  48.65 
 
 
97 aa  44.3  0.0006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.354425 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0049  hypothetical protein  28.75 
 
 
144 aa  43.1  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0104  protein of unknown function DUF971  40 
 
 
121 aa  42.4  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0393  hypothetical protein  46.34 
 
 
123 aa  41.6  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1557  hypothetical protein  26.47 
 
 
117 aa  41.2  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.147587  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6815  protein of unknown function DUF971  34.92 
 
 
101 aa  41.6  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45400  hypothetical protein  36.71 
 
 
124 aa  41.2  0.005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.40933  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_1494  predicted protein  36.11 
 
 
438 aa  40.4  0.007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6196  hypothetical protein  27.62 
 
 
124 aa  40.4  0.009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.710102  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0110  protein of unknown function DUF971  24.32 
 
 
108 aa  40.4  0.009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1632  hypothetical protein  33.8 
 
 
135 aa  40  0.01  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0464057  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2699  heat shock protein DnaJ  36.84 
 
 
134 aa  40  0.01  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00021338 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>