33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0579 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_0579  hypothetical protein  100 
 
 
185 aa  361  3e-99  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.336002  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4017  hypothetical protein  63.78 
 
 
207 aa  239  2e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0739843 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3529  hypothetical protein  50.85 
 
 
176 aa  151  4e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.452767  normal  0.831541 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1206  hypothetical protein  50.85 
 
 
176 aa  151  4e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0712  hypothetical protein  45.11 
 
 
205 aa  133  9.999999999999999e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.583463  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3838  hypothetical protein  47.68 
 
 
163 aa  123  1e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0788301  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3174  hypothetical protein  51.26 
 
 
150 aa  116  1.9999999999999998e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0525  hypothetical protein  51.3 
 
 
174 aa  108  5e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2866  hypothetical protein  38.25 
 
 
237 aa  102  2e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.794239  normal  0.0242431 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3074  hypothetical protein  36 
 
 
177 aa  100  1e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.426221  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3911  hypothetical protein  36.41 
 
 
192 aa  98.6  5e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3345  hypothetical protein  45.61 
 
 
173 aa  87.8  8e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.126619  normal  0.961104 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3815  hypothetical protein  43.09 
 
 
124 aa  84  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.757001 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0761  hypothetical protein  42.11 
 
 
169 aa  83.6  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.900094 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3017  hypothetical protein  45.83 
 
 
177 aa  81.6  0.000000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3182  hypothetical protein  44.25 
 
 
167 aa  81.6  0.000000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00860952  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1514  hypothetical protein  41.96 
 
 
131 aa  81.3  0.000000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.338897 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2247  hypothetical protein  35.71 
 
 
248 aa  80.9  0.000000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1487  hypothetical protein  34.76 
 
 
211 aa  74.7  0.0000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0127  hypothetical protein  36.13 
 
 
149 aa  67  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.488443  normal  0.651433 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7729  hypothetical protein  64.71 
 
 
62 aa  65.9  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0250143  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7429  hypothetical protein  36.97 
 
 
185 aa  63.5  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0751032 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1036  hypothetical protein  37.72 
 
 
138 aa  63.5  0.000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.128051  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3365  hypothetical protein  36.61 
 
 
124 aa  62  0.000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.828629  normal  0.105235 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3067  hypothetical protein  63.04 
 
 
58 aa  62  0.000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.205429 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2339  hypothetical protein  33.6 
 
 
148 aa  53.9  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3560  hypothetical protein  34.23 
 
 
148 aa  52.8  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2796  hypothetical protein  27.23 
 
 
203 aa  52.4  0.000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.232161  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1810  hypothetical protein  45.59 
 
 
261 aa  52  0.000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.187733  normal  0.988109 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0983  hypothetical protein  27.27 
 
 
173 aa  51.6  0.000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0672895  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3681  hypothetical protein  28.04 
 
 
258 aa  50.4  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1981  hypothetical protein  42.86 
 
 
273 aa  45.1  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.989492 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2327  hypothetical protein  46.55 
 
 
265 aa  42  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>