47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene WD0673 on replicon NC_002978
Organism: Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002978  WD0673  50S ribosomal protein L29  100 
 
 
67 aa  131  3e-30  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.254675  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0417  50S ribosomal protein L29  52.24 
 
 
67 aa  64.7  0.0000000004  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.716447  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0604  50S ribosomal protein L29  44.78 
 
 
67 aa  59.3  0.00000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.981275  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5062  50S ribosomal protein L29  40 
 
 
68 aa  48.1  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.545578 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3659  50S ribosomal protein L29  38.33 
 
 
69 aa  47  0.00008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000152137  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0345  ribosomal protein L29  40.68 
 
 
71 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.726774  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0994  50S ribosomal protein L29  41.54 
 
 
66 aa  45.4  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0283422 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2526  50S ribosomal protein L29  37.29 
 
 
67 aa  45.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1916  ribosomal protein L29  41.51 
 
 
71 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.174298  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1553  50S ribosomal protein L29  36.92 
 
 
68 aa  45.1  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1848  50S ribosomal protein L29  40 
 
 
66 aa  44.7  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.15271  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1670  50S ribosomal protein L29  41.82 
 
 
66 aa  44.7  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0221065  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1724  50S ribosomal protein L29  38.18 
 
 
68 aa  44.3  0.0005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0369  50S ribosomal protein L29  38.18 
 
 
68 aa  44.3  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3659  50S ribosomal protein L29  37.7 
 
 
69 aa  43.9  0.0008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1372  50S ribosomal protein L29  35.38 
 
 
68 aa  43.5  0.0009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.232248  normal  0.529222 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2226  ribosomal protein L29  37.74 
 
 
71 aa  43.5  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1622  50S ribosomal protein L29  45.45 
 
 
64 aa  43.5  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.173705  normal  0.463697 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3176  50S ribosomal protein L29  36.07 
 
 
69 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.909718 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2766  ribosomal protein L29  39.68 
 
 
67 aa  43.5  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000000105507  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20790  LSU ribosomal protein L29P  36.21 
 
 
78 aa  43.1  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.888777  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1687  50S ribosomal protein L29  39.34 
 
 
70 aa  42.7  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.000000411175  hitchhiker  0.00000000390358 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1964  50S ribosomal protein L29  40 
 
 
74 aa  42.4  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0409879  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1225  50S ribosomal protein L29  36.92 
 
 
66 aa  42.7  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2303  50S ribosomal protein L29  36.07 
 
 
69 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0116105  normal  0.098127 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0767  ribosomal protein L29  31.75 
 
 
92 aa  42.7  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.211892  normal  0.786467 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1188  50S ribosomal protein L29  36.92 
 
 
66 aa  42.7  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.328591  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0262  50S ribosomal protein L29  35 
 
 
66 aa  42.4  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.582427  normal  0.636432 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0293  50S ribosomal protein L29  31.67 
 
 
68 aa  41.6  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2147  50S ribosomal protein L29P  34.92 
 
 
67 aa  42  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.018623  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1362  ribosomal protein L29  37.29 
 
 
70 aa  42  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.494656  normal  0.0336021 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2974  50S ribosomal protein L29  34.62 
 
 
79 aa  42  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.997663  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1176  ribosomal protein L29  35 
 
 
71 aa  41.6  0.004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00096654  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3440  50S ribosomal protein L29  36.92 
 
 
68 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.696272  normal  0.342905 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1787  50S ribosomal protein L29P  31.34 
 
 
68 aa  41.6  0.004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.063594  normal  0.106706 
 
 
-
 
NC_006670  CNA07490  ribosomal protein L35, putative  35 
 
 
127 aa  41.2  0.005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.0097389  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85685  predicted protein  38.98 
 
 
120 aa  41.2  0.005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0989  ribosomal protein L29  40.35 
 
 
67 aa  41.2  0.005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2131  ribosomal protein L29  35.85 
 
 
71 aa  40.8  0.006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.579075  normal  0.483712 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2448  ribosomal protein L29  35.85 
 
 
71 aa  40.8  0.006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.338512  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2170  ribosomal protein L29  35.85 
 
 
71 aa  40.8  0.006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.350085 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2911  50S ribosomal protein L29  40 
 
 
67 aa  40.8  0.006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2810  50S ribosomal protein L29  37.93 
 
 
67 aa  40.8  0.007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.902927  normal  0.445457 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1938  50S ribosomal protein L29  34.62 
 
 
68 aa  40.4  0.007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4500  50S ribosomal protein L29  37.7 
 
 
62 aa  40.4  0.008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00015602  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1438  50S ribosomal protein L29  38.18 
 
 
66 aa  40.4  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.397663  normal  0.137292 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1340  50S ribosomal protein L29  38.18 
 
 
66 aa  40  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.282614  normal  0.101292 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>