17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_85685 on replicon NC_009048
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009048  PICST_85685  predicted protein  100 
 
 		 120 aa  235  1e-61  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA07490  ribosomal protein L35, putative  59.17 
 
 		 127 aa  125  3e-28  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.0097389  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01228  60S ribosomal protein L35 (AFU_orthologue; AFUA_1G10510)  58.33 
 
 		 124 aa  107  8.000000000000001e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.685819 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31613  Ribosomal protein L35, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  48.78 
 
 		 123 aa  99.4  1e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.0013308 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_19615  predicted protein  49.17 
 
 		 121 aa  97.1  7e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0767  ribosomal protein L29  44.83 
 
 		 92 aa  45.8  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.211892  normal  0.786467 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0369  50S ribosomal protein L29  46.3 
 
 		 68 aa  44.7  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1724  50S ribosomal protein L29  46.3 
 
 		 68 aa  44.7  0.0004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2526  50S ribosomal protein L29  46.3 
 
 		 67 aa  44.7  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3659  50S ribosomal protein L29  50.94 
 
 		 69 aa  43.5  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000152137  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2810  50S ribosomal protein L29  43.1 
 
 		 67 aa  41.6  0.004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.902927  normal  0.445457 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2147  50S ribosomal protein L29P  42.62 
 
 		 67 aa  41.6  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.018623  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0673  50S ribosomal protein L29  38.98 
 
 		 67 aa  41.2  0.005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.254675  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1257  50S ribosomal protein L29  43.1 
 
 		 68 aa  40.8  0.006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.681642  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0989  ribosomal protein L29  43.1 
 
 		 67 aa  40.4  0.007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0994  50S ribosomal protein L29  44.83 
 
 		 66 aa  40.4  0.008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0283422 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0716  50S ribosomal protein L29P  40.32 
 
 		 71 aa  40  0.01  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.006076  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>