More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene WD0488 on replicon NC_002978
Organism: Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002978  WD0488  NADP-dependent malic enzyme  100 
 
 
440 aa  898    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0118  malic enzyme  71.23 
 
 
763 aa  640    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.964917  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0175  malic enzyme  70.77 
 
 
758 aa  634  1e-180  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0848  malic enzyme  62.85 
 
 
760 aa  574  1.0000000000000001e-163  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0210  malic enzyme  62.82 
 
 
754 aa  573  1.0000000000000001e-162  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3598  malic enzyme  62.33 
 
 
754 aa  568  1e-161  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1217  malic enzyme  62.62 
 
 
759 aa  566  1e-160  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2878  malic enzyme  62.85 
 
 
751 aa  567  1e-160  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3467  malic enzyme  61.21 
 
 
752 aa  561  1.0000000000000001e-159  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3542  malic enzyme  62.44 
 
 
753 aa  562  1.0000000000000001e-159  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.196969  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6546  malic enzyme  63.26 
 
 
763 aa  559  1e-158  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00415909  normal  0.365189 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7102  malic enzyme  62.56 
 
 
763 aa  553  1e-156  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.30073  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0048  malic enzyme  61.34 
 
 
761 aa  551  1e-156  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2654  malic enzyme  62.85 
 
 
751 aa  552  1e-156  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.820528 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0158  malic enzyme  61.77 
 
 
764 aa  550  1e-155  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2877  malic enzyme  62.04 
 
 
751 aa  547  1e-154  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.857329 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1700  malic enzyme  60.56 
 
 
752 aa  540  9.999999999999999e-153  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1637  malic enzyme  60.32 
 
 
752 aa  540  9.999999999999999e-153  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000270094  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0029  malic enzyme  62.27 
 
 
761 aa  538  9.999999999999999e-153  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000328842 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0033  malic enzyme  61.34 
 
 
761 aa  540  9.999999999999999e-153  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.43478 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4030  malic enzyme  61.4 
 
 
761 aa  535  1e-151  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3020  malic enzyme  59.23 
 
 
761 aa  530  1e-149  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2760  malic enzyme  60.36 
 
 
753 aa  526  1e-148  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4968  malic enzyme  58.24 
 
 
762 aa  525  1e-148  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2798  malic enzyme  60.38 
 
 
780 aa  523  1e-147  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.272512 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1888  malic enzyme  60.14 
 
 
749 aa  518  1e-146  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2321  malic enzyme  60.14 
 
 
749 aa  520  1e-146  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0420  malic enzyme  60.66 
 
 
750 aa  521  1e-146  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1455  malic enzyme  59.43 
 
 
779 aa  519  1e-146  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.163734  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3291  malic enzyme  61.21 
 
 
754 aa  514  1.0000000000000001e-145  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.442539  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2792  malic enzyme  61.07 
 
 
754 aa  516  1.0000000000000001e-145  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.776027  normal  0.163091 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3833  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating) (NADP(+))., Phosphate acetyltransferase  58.95 
 
 
771 aa  512  1e-144  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.701616  normal  0.763898 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1298  malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating) (NADP+)  60.1 
 
 
440 aa  514  1e-144  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2616  malic enzyme  59.86 
 
 
759 aa  509  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2838  malic enzyme  59.86 
 
 
759 aa  509  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2664  malic enzyme  59.86 
 
 
759 aa  509  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2731  malic enzyme  59.86 
 
 
759 aa  509  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2705  malic enzyme  59.86 
 
 
759 aa  509  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0027  malic enzyme  58.53 
 
 
757 aa  506  9.999999999999999e-143  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.376486  normal  0.721374 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2958  malic enzyme  59.38 
 
 
759 aa  506  9.999999999999999e-143  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.692294 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02354  malic enzyme  59.14 
 
 
759 aa  503  1e-141  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1207  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating) (NADP(+))., Phosphate acetyltransferase  59.14 
 
 
759 aa  503  1e-141  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.795246  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3684  malic enzyme  59.14 
 
 
759 aa  502  1e-141  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.392037  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2609  malic enzyme  59.14 
 
 
759 aa  502  1e-141  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2829  malic enzyme  59.14 
 
 
759 aa  502  1e-141  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.946085  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3472  malic enzyme  58.19 
 
 
759 aa  503  1e-141  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.382642  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2592  malic enzyme  59.14 
 
 
759 aa  503  1e-141  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02316  hypothetical protein  59.14 
 
 
759 aa  503  1e-141  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1214  malic enzyme  59.14 
 
 
759 aa  503  1e-141  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2741  malic enzyme  59.14 
 
 
759 aa  502  1e-141  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2073  malic enzyme  58.7 
 
 
752 aa  500  1e-140  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000040152  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0754  malic enzyme  58.19 
 
 
759 aa  499  1e-140  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0943824  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3213  malic enzyme  57.96 
 
 
759 aa  499  1e-140  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3292  malic enzyme  57.72 
 
 
759 aa  498  1e-140  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0248  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating) (NADP(+))., Phosphate acetyltransferase  57.04 
 
 
757 aa  500  1e-140  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01220  NADP-dependent malate dehydrogenase  55.99 
 
 
766 aa  499  1e-140  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.189364  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1262  malic enzyme  59.62 
 
 
752 aa  499  1e-140  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00802649  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3484  malic enzyme  59.33 
 
 
749 aa  497  1e-139  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0502  malic enzyme  57.58 
 
 
773 aa  495  1e-139  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.214908  normal  0.395596 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0246  malic enzyme  58.31 
 
 
776 aa  496  1e-139  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.838857  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1333  malic enzyme  59.1 
 
 
758 aa  495  1e-139  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.306693 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0990  malic enzyme  58.19 
 
 
759 aa  496  1e-139  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1209  oxaloacetate-decarboxylating malate dehydrogenase (NADP(+)) phosphate acetyltransferase  57.52 
 
 
761 aa  495  1e-139  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000448619 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0765  malic enzyme  57.78 
 
 
754 aa  493  9.999999999999999e-139  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0423248  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1029  malic enzyme  58.22 
 
 
764 aa  494  9.999999999999999e-139  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0401  malate dehydrogenase  60.64 
 
 
422 aa  491  9.999999999999999e-139  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.215964  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3674  malic enzyme  58.19 
 
 
760 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0789225  hitchhiker  0.00000000707391 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0283  malic enzyme  58.16 
 
 
760 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00767286 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2869  malic enzyme  57.96 
 
 
761 aa  489  1e-137  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000177126 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5134  malic enzyme family protein  60.4 
 
 
422 aa  488  1e-137  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0185619  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0245  malic enzyme  57.96 
 
 
756 aa  488  1e-137  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000009441 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1651  malic enzyme  56.45 
 
 
763 aa  491  1e-137  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2788  malic enzyme  57.72 
 
 
756 aa  488  1e-137  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0237  malic enzyme  57.96 
 
 
756 aa  488  1e-137  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0318  malic enzyme  57.72 
 
 
756 aa  488  1e-137  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3722  malic enzyme  56.53 
 
 
766 aa  486  1e-136  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0380  malate dehydrogenase  59.65 
 
 
425 aa  485  1e-136  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3417  malic enzyme  57.72 
 
 
756 aa  488  1e-136  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.154841  normal  0.983896 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1243  malic enzyme  56.29 
 
 
769 aa  488  1e-136  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0220  malic enzyme  57.48 
 
 
756 aa  486  1e-136  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.667581  hitchhiker  0.000000000555006 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3876  malic enzyme  58.27 
 
 
769 aa  487  1e-136  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.201393 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5135  malate dehydrogenase  59.65 
 
 
425 aa  486  1e-136  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0298  malic enzyme  57.72 
 
 
756 aa  487  1e-136  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000250182 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5085  malic enzyme  59.41 
 
 
422 aa  484  1e-135  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.14164  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3123  malic enzyme  56.5 
 
 
756 aa  482  1e-135  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3849  malic enzyme  56.5 
 
 
756 aa  482  1e-135  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.416227  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2586  malic enzyme  56.5 
 
 
756 aa  482  1e-135  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3788  malic enzyme  56.5 
 
 
756 aa  482  1e-135  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0019  malic enzyme  56.77 
 
 
773 aa  482  1e-135  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3524  malic enzyme  56.5 
 
 
756 aa  482  1e-135  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.753922  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4958  malate dehydrogenase  59.41 
 
 
425 aa  484  1e-135  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3533  malic enzyme  56.5 
 
 
756 aa  482  1e-135  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.78558  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2289  malic enzyme  56.77 
 
 
757 aa  483  1e-135  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.999733  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2911  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating) (NADP(+))., Phosphate acetyltransferase  55.37 
 
 
755 aa  481  1e-135  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1324  malic enzyme  58.95 
 
 
749 aa  484  1e-135  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.591813  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1391  malic enzyme  58.67 
 
 
759 aa  482  1e-135  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.603057  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2328  malic enzyme  55.58 
 
 
775 aa  482  1e-135  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.283617  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1277  malic enzyme  58.67 
 
 
759 aa  482  1e-135  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1969  malic enzyme  56.5 
 
 
756 aa  482  1e-135  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.725411  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45330  malate dehydrogenase (oxaloacetate decarboxylating) (NADP+)  58.42 
 
 
422 aa  478  1e-134  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.696381  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>