86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_1413 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_1413  transposase, IS4 family protein  100 
 
 
462 aa  952    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.106317  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4941  transposase, IS4 family protein  98.66 
 
 
380 aa  603  1.0000000000000001e-171  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.491222 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4842  hypothetical protein  54.86 
 
 
445 aa  418  1e-116  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2215  transposase, IS4 family protein  54.86 
 
 
439 aa  420  1e-116  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.501331  normal  0.787142 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2775  transposase, IS4 family protein  54.86 
 
 
439 aa  420  1e-116  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0055865 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1752  hypothetical protein  54.86 
 
 
445 aa  418  1e-116  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.227885  normal  0.59787 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4729  hypothetical protein  54.86 
 
 
445 aa  418  1e-116  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.199919  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3105  transposase, IS4 family protein  55.14 
 
 
439 aa  421  1e-116  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0428603 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3107  transposase, IS4 family protein  54.86 
 
 
419 aa  419  1e-116  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0395714 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3660  transposase, IS4 family protein  54.86 
 
 
439 aa  420  1e-116  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4481  hypothetical protein  55.14 
 
 
441 aa  414  1e-114  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.579978  hitchhiker  0.0000396419 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4825  hypothetical protein  53.24 
 
 
441 aa  409  1e-113  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4752  hypothetical protein  52.97 
 
 
441 aa  405  1e-111  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.839178  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3113  hypothetical protein  53.45 
 
 
293 aa  256  5e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12240  transposase  35.01 
 
 
460 aa  208  1e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33340  transposase  35.01 
 
 
460 aa  207  3e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31320  transposase  34.75 
 
 
460 aa  202  7e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18270  transposase  34.75 
 
 
460 aa  202  8e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18340  transposase  34.75 
 
 
460 aa  202  8e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.308708  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0419  IS4 family transposase  53.5 
 
 
164 aa  182  8.000000000000001e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.216929 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0421  hypothetical protein  58.11 
 
 
187 aa  181  2.9999999999999997e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2515  transposase IS4 family protein  31.02 
 
 
467 aa  177  5e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.99983  normal  0.0630319 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2199  transposase Tn5  30.75 
 
 
467 aa  174  2.9999999999999996e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.334008  hitchhiker  0.00000000355698 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4034  hypothetical protein  31.79 
 
 
470 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.287551 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4025  hypothetical protein  31.79 
 
 
470 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5887  transposase IS4 family protein  30.21 
 
 
481 aa  161  3e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000153597 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8279  transposase  29.23 
 
 
473 aa  154  2e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0165  IS4 family transposase  51.75 
 
 
212 aa  147  3e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0055531  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4951  hypothetical protein  57.26 
 
 
132 aa  142  9.999999999999999e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.248425  normal  0.419329 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2627  hypothetical protein  27.47 
 
 
457 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1301  putative transposase  31.7 
 
 
482 aa  129  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3078  putative transposase  31.7 
 
 
482 aa  129  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.049818  normal  0.456044 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3410  transposase Tn5  29.66 
 
 
322 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3941  hypothetical protein  28.05 
 
 
361 aa  121  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01865  hypothetical protein  27.98 
 
 
379 aa  108  3e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04959  hypothetical protein  27.9 
 
 
403 aa  107  3e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02641  hypothetical protein  27.9 
 
 
406 aa  107  3e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02188  hypothetical protein  27.9 
 
 
459 aa  107  3e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00950  hypothetical protein  27.9 
 
 
459 aa  107  3e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06704  hypothetical protein  27.9 
 
 
459 aa  107  4e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06289  hypothetical protein  27.9 
 
 
459 aa  107  4e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06260  hypothetical protein  27.9 
 
 
459 aa  107  4e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06152  hypothetical protein  27.9 
 
 
459 aa  107  4e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06773  hypothetical protein  27.9 
 
 
459 aa  107  4e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03586  hypothetical protein  27.9 
 
 
459 aa  107  4e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03113  hypothetical protein  27.9 
 
 
459 aa  107  4e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02282  hypothetical protein  27.9 
 
 
459 aa  107  4e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02919  hypothetical protein  27.9 
 
 
459 aa  107  4e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06945  hypothetical protein  27.9 
 
 
459 aa  107  4e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05657  hypothetical protein  27.9 
 
 
459 aa  107  5e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03267  hypothetical protein  27.9 
 
 
459 aa  107  5e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03172  hypothetical protein  27.9 
 
 
459 aa  107  5e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05721  hypothetical protein  27.9 
 
 
459 aa  107  5e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05509  hypothetical protein  27.9 
 
 
459 aa  107  5e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01127  hypothetical protein  27.9 
 
 
459 aa  107  5e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00115  transposase  27.9 
 
 
459 aa  107  5e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00293  hypothetical protein  27.9 
 
 
459 aa  107  6e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0704  transposase, IS4 family protein  32.14 
 
 
453 aa  105  1e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03190  hypothetical protein  28.08 
 
 
448 aa  104  3e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03176  hypothetical protein  28.08 
 
 
391 aa  104  3e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4952  IS4 family transposase  43.52 
 
 
108 aa  99  1e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.450455  normal  0.665267 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0184  hypothetical protein  26.08 
 
 
472 aa  95.5  2e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0064  hypothetical protein  26.08 
 
 
472 aa  95.5  2e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0195  hypothetical protein  26.08 
 
 
472 aa  95.5  2e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1893  hypothetical protein  26.08 
 
 
472 aa  95.5  2e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6437  hypothetical protein  66.67 
 
 
128 aa  95.5  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.8669  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1424  hypothetical protein  26.08 
 
 
472 aa  95.1  3e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02340  hypothetical protein  27.86 
 
 
407 aa  94.4  4e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41930  transposase  33.77 
 
 
234 aa  93.6  7e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.209589  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2032  hypothetical protein  25.82 
 
 
472 aa  93.2  9e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2772  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, beta subunit  95 
 
 
254 aa  86.7  9e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00472315 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00456  hypothetical protein  29.11 
 
 
259 aa  74.7  0.000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00498  hypothetical protein  29.11 
 
 
259 aa  74.7  0.000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2972  hypothetical protein  30.14 
 
 
283 aa  73.6  0.000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0469532  normal  0.67832 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03704  hypothetical protein  28.33 
 
 
316 aa  67.4  0.0000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1482  hypothetical protein  29.03 
 
 
261 aa  60.8  0.00000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3096  transposase Tn5  37.04 
 
 
126 aa  57.4  0.0000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1573  putative transposase  27.21 
 
 
395 aa  55.1  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.153836 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4950  hypothetical protein  57.14 
 
 
63 aa  47.8  0.0005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.694438  normal  0.307678 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03703  hypothetical protein  32.58 
 
 
120 aa  45.1  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05272  hypothetical protein  30.71 
 
 
243 aa  44.7  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05271  hypothetical protein  30.95 
 
 
110 aa  43.9  0.007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00457  hypothetical protein  40 
 
 
194 aa  43.5  0.007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00497  hypothetical protein  40 
 
 
194 aa  43.5  0.007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4406  hypothetical protein  34.48 
 
 
285 aa  43.5  0.008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3473  hypothetical protein  33.56 
 
 
223 aa  43.1  0.009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.848098  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>