67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_5265 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_5265  amine oxidase  100 
 
 		 543 aa  1079    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4735  amine oxidase  63.77 
 
 		 582 aa  602  1.0000000000000001e-171  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4093  twin-arginine translocation pathway signal  62.16 
 
 		 583 aa  598  1e-170  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.139116 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4784  twin-arginine translocation pathway signal  54.97 
 
 		 580 aa  511  1e-144  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.370329  normal  0.538612 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0250  hypothetical protein  52.22 
 
 		 562 aa  497  1e-139  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.280339 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3715  twin-arginine translocation pathway signal  44.02 
 
 		 550 aa  370  1e-101  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.697054  normal  0.0792167 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1568  twin-arginine translocation pathway signal  35.21 
 
 		 536 aa  339  7e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0112  FAD dependent oxidoreductase  41.92 
 
 		 487 aa  337  1.9999999999999998e-91  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0699636 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3462  hypothetical protein  39.69 
 
 		 556 aa  304  3.0000000000000004e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3305  hypothetical protein  38.88 
 
 		 555 aa  281  2e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0711795  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0815  hypothetical protein  38.92 
 
 		 539 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.198934  normal  0.440167 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4801  hypothetical protein  39.31 
 
 		 539 aa  274  3e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.717214  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4274  hypothetical protein  39.31 
 
 		 539 aa  273  6e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.928776  normal  0.0737697 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3472  hypothetical protein  38.92 
 
 		 539 aa  272  1e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4894  hypothetical protein  38.92 
 
 		 539 aa  272  1e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5392  hypothetical protein  38.92 
 
 		 539 aa  272  1e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4231  amine oxidase  38.31 
 
 		 540 aa  267  2.9999999999999995e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.179579  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4119  amine oxidase  38.31 
 
 		 540 aa  267  2.9999999999999995e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.670379  normal  0.0166866 
 
 
-
 
NC_003296  RS05692  putative transmembrane protein  38.21 
 
 		 540 aa  259  1e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04763  hypothetical protein  38.21 
 
 		 540 aa  259  1e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1544  amine oxidase  25.74 
 
 		 504 aa  84.7  0.000000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.268529 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4441  Amine oxidase (flavin-containing)  26.79 
 
 		 498 aa  56.2  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.358617 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4331  Amine oxidase (flavin-containing)  26.79 
 
 		 498 aa  56.2  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0789189 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6829  amine oxidase  26.79 
 
 		 492 aa  53.9  0.000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.423551  normal  0.420009 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2837  amine oxidase  36.78 
 
 		 448 aa  52  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  hitchhiker  0.00868437  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1866  amine oxidase  28.41 
 
 		 447 aa  51.6  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.591896  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3427  putative monooxygenase  32.26 
 
 		 483 aa  51.2  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.16956 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6833  amine oxidase  26.91 
 
 		 532 aa  50.4  0.00009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.574218  normal  0.40808 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13065  monooxygenase  35.29 
 
 		 524 aa  49.7  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.118559 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1556  amine oxidase (flavin-containing)  28.29 
 
 		 450 aa  48.9  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1580  amine oxidase (flavin-containing)  28.29 
 
 		 450 aa  48.9  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2885  putative flavin-binding monooxygenase  44.07 
 
 		 489 aa  47.8  0.0005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44560  putative flavin-containing monooxygenase  36.51 
 
 		 527 aa  47.8  0.0006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.554415 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3649  flavin-containing monooxygenase FMO  42.62 
 
 		 488 aa  47.4  0.0007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3083  FAD dependent oxidoreductase  30.43 
 
 		 650 aa  47  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.620429  normal  0.485634 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4356  amine oxidase  40.45 
 
 		 493 aa  47  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1498  flavin-binding monooxygenase-like protein  44.64 
 
 		 524 aa  46.6  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.967842  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0459  FAD dependent oxidoreductase  33.03 
 
 		 520 aa  46.6  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0671859 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1633  hypothetical protein  20.78 
 
 		 634 aa  46.6  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00578112  normal  0.776269 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05890  conserved hypothetical protein  27.91 
 
 		 492 aa  45.8  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.314478  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1789  flavin-binding monooxygenase  37.5 
 
 		 531 aa  45.8  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000161654 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06658  flavin containing polyamine oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G03510)  48.84 
 
 		 536 aa  45.1  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.182585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0365  hypothetical protein  26.09 
 
 		 644 aa  45.4  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0591662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4287  putative monooxygenase  40.98 
 
 		 506 aa  45.1  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.691811  normal  0.526201 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2685  amine oxidase, flavin-containing  25.8 
 
 		 449 aa  45.1  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.327813  normal  0.0635309 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4879  FAD dependent oxidoreductase  36.92 
 
 		 533 aa  45.4  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0491968  normal  0.91768 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2889  Protoporphyrinogen oxidase-like protein  31.52 
 
 		 496 aa  44.7  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.693571  normal  0.756055 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3835  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  45.28 
 
 		 485 aa  45.1  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37380  putative flavin-binding monooxygenase  31.25 
 
 		 491 aa  44.7  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000000202152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3795  putative flavin-containing monooxygenase  26.05 
 
 		 514 aa  45.1  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.790052  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1006  amine oxidase  33.63 
 
 		 387 aa  44.3  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.74329  hitchhiker  0.00000000109904 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3325  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  49.06 
 
 		 529 aa  44.7  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6401  twin-arginine translocation pathway signal  50.98 
 
 		 493 aa  44.3  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0942  amine oxidase  21.6 
 
 		 449 aa  44.3  0.005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.15931  normal  0.877558 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0882  flavin monoamine oxidase family protein  33.63 
 
 		 387 aa  44.3  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28920  predicted flavoprotein involved in K+ transport  43.64 
 
 		 505 aa  44.3  0.006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.264104 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4430  flavin-containing monooxygenase FMO  44.44 
 
 		 487 aa  43.9  0.007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0263565  normal  0.618876 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4320  flavin-containing monooxygenase FMO  44.44 
 
 		 487 aa  43.9  0.007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.936959  normal  0.129741 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1890  flavoprotein involved in K+ transport-like protein  44.44 
 
 		 491 aa  43.9  0.007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0239259  normal  0.786359 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4608  FAD dependent oxidoreductase  44.23 
 
 		 556 aa  43.9  0.007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5037  amine oxidase (flavin-containing)  25.48 
 
 		 493 aa  43.9  0.008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5823  amine oxidase (flavin-containing)  25.48 
 
 		 493 aa  43.9  0.008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.105573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2059  putative monooxygenase  33.06 
 
 		 506 aa  43.9  0.008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.587027 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2259  amine oxidase  40.54 
 
 		 459 aa  43.9  0.008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00770255  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01808  L-amino acid oxidase LaoA (AFU_orthologue; AFUA_7G06810)  29.81 
 
 		 698 aa  43.9  0.008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.308702 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5048  twin-arginine translocation pathway signal  45.21 
 
 		 578 aa  43.5  0.009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4019  FAD dependent oxidoreductase  31.78 
 
 		 525 aa  43.5  0.01  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.122722  normal  0.797146 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>