276 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_1853 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_1853  Glutathione S-transferase domain protein  100 
 
 		 227 aa  461  1e-129  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.889087  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4710  glutathione S-transferase family protein  60.27 
 
 		 225 aa  274  6e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.352586 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2409  glutathione S-transferase-like protein  44.44 
 
 		 213 aa  171  9e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.216575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0059  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.62 
 
 		 209 aa  121  9.999999999999999e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1717  hypothetical protein  30.96 
 
 		 205 aa  94.7  9e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00440714 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2192  putative transferase  31.16 
 
 		 205 aa  93.6  3e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000130719  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3736  glutathione S-transferase-like protein  32.06 
 
 		 207 aa  93.2  3e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2205  putative transferase  30.65 
 
 		 199 aa  92  7e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000311341  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01411  predicted enzyme  30.15 
 
 		 205 aa  91.7  8e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0982853  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01422  hypothetical protein  30.15 
 
 		 205 aa  91.7  8e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.112928  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1541  transferase-like protein  30.65 
 
 		 205 aa  91.7  8e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2061  transferase homolog  30.5 
 
 		 205 aa  90.9  1e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.40071  normal  0.023691 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5316  Glutathione S-transferase domain  30.95 
 
 		 220 aa  86.7  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.591495  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4826  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.84 
 
 		 211 aa  85.9  5e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.3512  normal  0.0149427 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3061  putative glutathione S-transferase  29.35 
 
 		 215 aa  85.5  6e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2653  Glutathione S-transferase domain  30.41 
 
 		 211 aa  80.5  0.00000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.520035  normal  0.305227 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2161  glutathione S-transferase domain-containing protein  24.84 
 
 		 199 aa  79.7  0.00000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1699  Glutathione S-transferase domain protein  33.52 
 
 		 211 aa  79.3  0.00000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1727  putative transferase  32.7 
 
 		 165 aa  79  0.00000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.214666  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4988  glutathione S-transferase-like protein  31.1 
 
 		 215 aa  78.6  0.00000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0847  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.87 
 
 		 200 aa  77.8  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.154484 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0243  glutathione S-transferase-like  30.54 
 
 		 220 aa  76.6  0.0000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1471  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.35 
 
 		 213 aa  75.9  0.0000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.214549 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22380  Glutathione S-transferase protein  29.31 
 
 		 206 aa  75.9  0.0000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3680  glutathione S-transferase  32.47 
 
 		 215 aa  74.3  0.000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0178  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.58 
 
 		 204 aa  73.6  0.000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1012  glutathione S-transferase-like protein  29.74 
 
 		 201 aa  73.9  0.000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0197  Glutathione S-transferase domain protein  31.58 
 
 		 204 aa  73.9  0.000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1775  glutathionine S-transferase  30.41 
 
 		 201 aa  73.6  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2552  glutathionine S-transferase  30.41 
 
 		 201 aa  73.6  0.000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.183983  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1883  glutathionine S-transferase  30.41 
 
 		 201 aa  73.6  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0259  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.82 
 
 		 205 aa  73.2  0.000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0074  glutathione S-transferase  27.14 
 
 		 203 aa  72.8  0.000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2749  putative glutathione S-transferase  24.86 
 
 		 216 aa  72.8  0.000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.414425  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6685  glutathione S-transferase  28.5 
 
 		 214 aa  72.8  0.000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.50271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0065  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.03 
 
 		 213 aa  72.8  0.000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.167606  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0888  Glutathione S-transferase domain  28.43 
 
 		 204 aa  72.4  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5317  glutathione S-transferase  29.44 
 
 		 196 aa  72  0.000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.614599  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0607  putative glutathione S-transferase protein  32.79 
 
 		 213 aa  72  0.000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.254773 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1820  glutathione S-transferase-like protein  31.77 
 
 		 201 aa  72  0.000000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.631165 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5526  Glutathione S-transferase domain protein  29.94 
 
 		 202 aa  72  0.000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.714994  hitchhiker  0.000295596 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0310  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.3 
 
 		 202 aa  70.5  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1358  Glutathione S-transferase domain  31.53 
 
 		 206 aa  70.9  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.462445  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0537  glutathione S-transferase domain-containing protein  28 
 
 		 227 aa  70.1  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0787  Glutathione S-transferase domain  30.26 
 
 		 206 aa  70.1  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.156046 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0903  Glutathione S-transferase domain protein  28.21 
 
 		 206 aa  69.7  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.600901  normal  0.429036 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2423  putative glutathione S-transferase  27.5 
 
 		 217 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.171803  normal  0.428132 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1139  Glutathione S-transferase domain  32.18 
 
 		 203 aa  68.9  0.00000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.328296  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2666  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.24 
 
 		 217 aa  68.9  0.00000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0074512  normal  0.597042 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5427  Glutathione transferase  30.77 
 
 		 205 aa  68.9  0.00000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0721  glutathione S-transferase  27.01 
 
 		 208 aa  68.9  0.00000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.195478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2221  glutathionine S-transferase  28.25 
 
 		 201 aa  68.2  0.00000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0005501 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0571  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.65 
 
 		 206 aa  68.6  0.00000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.382264  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4603  glutathione S-transferase-like protein  27.41 
 
 		 204 aa  68.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3564  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.05 
 
 		 211 aa  67.8  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.146055  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2328  glutathione S-transferase  25.26 
 
 		 205 aa  67.4  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2979  glutathione S-transferase  26.74 
 
 		 211 aa  67  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.978891  normal  0.125467 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2508  Glutathione S-transferase domain  28.57 
 
 		 214 aa  67.4  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3382  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.86 
 
 		 219 aa  67  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.485104  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3695  Glutathione S-transferase domain  31.25 
 
 		 215 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0434501  hitchhiker  0.00000154046 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0929  glutathione S-transferase  28.86 
 
 		 206 aa  66.2  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4837  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.81 
 
 		 206 aa  66.2  0.0000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4867  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.65 
 
 		 214 aa  65.9  0.0000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1904  Glutathione S-transferase domain protein  30.64 
 
 		 201 aa  65.5  0.0000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0818  glutathione S-transferase  26.73 
 
 		 204 aa  65.9  0.0000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2574  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.41 
 
 		 202 aa  65.5  0.0000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0127653 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22620  Glutathione S-transferase protein  29.23 
 
 		 201 aa  65.5  0.0000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.453028  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0039  glutathione S-transferase-like protein  28.5 
 
 		 218 aa  65.1  0.0000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6303  glutathione S-transferase-like protein  29.05 
 
 		 212 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.12515  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3954  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.24 
 
 		 205 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.251267 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0524  Glutathione S-transferase domain protein  29.44 
 
 		 222 aa  64.7  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1679  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.65 
 
 		 205 aa  63.9  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.141401  normal  0.230284 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0808  glutathione S-transferase-like  26.13 
 
 		 204 aa  64.3  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.513928  normal  0.412838 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5352  Glutathione S-transferase domain  30.23 
 
 		 214 aa  63.5  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2990  glutathione S-transferase domain-containing protein  42.53 
 
 		 204 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3341  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.57 
 
 		 210 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0108  glutathione S-transferase-like  28.65 
 
 		 204 aa  63.2  0.000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2853  glutathione S-transferase domain-containing protein  41.38 
 
 		 204 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.606213 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5178  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.57 
 
 		 211 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2964  glutathione S-transferase domain-containing protein  40.23 
 
 		 204 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2337  glutathione S-transferase-like  30.56 
 
 		 212 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0459494  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2951  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.56 
 
 		 212 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0451804  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2477  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.9 
 
 		 201 aa  62.8  0.000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3513  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.76 
 
 		 207 aa  62.4  0.000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.72335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5220  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.36 
 
 		 219 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0962693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2222  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.81 
 
 		 207 aa  62.4  0.000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.186295 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4145  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.9 
 
 		 203 aa  62.4  0.000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.167022 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2937  glutathione S-transferase domain-containing protein  40.23 
 
 		 204 aa  62  0.000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2860  glutathione S-transferase domain-containing protein  30 
 
 		 212 aa  62  0.000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.530245  normal  0.252245 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2972  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.56 
 
 		 212 aa  62  0.000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.435307 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3859  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.19 
 
 		 201 aa  62  0.000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.825157  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0144  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.82 
 
 		 205 aa  61.6  0.000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.764911  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0023  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.15 
 
 		 202 aa  61.2  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.529151 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0042  Glutathione S-transferase domain protein  26.26 
 
 		 202 aa  61.2  0.00000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.245539  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0537  Glutathione S-transferase domain  27.43 
 
 		 222 aa  61.2  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.213809  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1190  glutathione S-transferase (BphK)  27.33 
 
 		 203 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.557272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2329  glutathione S-transferase-like  40.23 
 
 		 204 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.209551  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1813  glutathionine S-transferase  27.59 
 
 		 201 aa  61.2  0.00000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000409061  decreased coverage  0.000277297 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2943  glutathione S-transferase domain-containing protein  40.23 
 
 		 204 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3181  glutathione S-transferase domain-containing protein  25.25 
 
 		 207 aa  61.6  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>