36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_1193 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_1193  putative polysaccharide pyruvyl transferase  100 
 
 		 387 aa  785    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0927448  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2576  polysaccharide pyruvyl transferase  35.23 
 
 		 406 aa  168  1e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3539  polysaccharide pyruvyl transferase  32.67 
 
 		 428 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6752  polysaccharide pyruvyl transferase  28.8 
 
 		 433 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.677486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3108  polysaccharide pyruvyl transferase  25 
 
 		 377 aa  76.6  0.0000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00646313  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0215  polysaccharide pyruvyl transferase  27.78 
 
 		 366 aa  67.4  0.0000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4399  polysaccharide pyruvyl transferase CsaB  26.19 
 
 		 362 aa  67  0.0000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0391258  hitchhiker  0.00000000000323458 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16400  polysaccharide pyruvyl transferase  25.25 
 
 		 373 aa  64.7  0.000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000229912  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0783  polysaccharide pyruvyl transferase  24.7 
 
 		 362 aa  62.4  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0727732  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2062  glycosyl transferase, WecB/TagA/CpsF family  25.38 
 
 		 612 aa  61.2  0.00000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000046039  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0123  polysaccharide pyruvyl transferase  26.85 
 
 		 356 aa  60.5  0.00000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000678569  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0713  polysaccharide pyruvyl transferase  24.08 
 
 		 369 aa  59.7  0.00000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.67475  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0102  polysaccharide pyruvyl transferase CsaB  27.44 
 
 		 367 aa  58.2  0.0000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0786  pyruvyl-transferase  23.05 
 
 		 375 aa  57.8  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00245875  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4122  polysaccharide pyruvyl transferase  23.42 
 
 		 367 aa  57.8  0.0000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000169583  unclonable  0.000000000262551 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2379  polysaccharide pyruvyl transferase  21.04 
 
 		 400 aa  56.6  0.0000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000108064  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2392  polysaccharide pyruvyl transferase  25.24 
 
 		 395 aa  55.8  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.692445  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0884  pyruvyl-transferase  23.53 
 
 		 367 aa  55.1  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0840  CsaB protein  23.53 
 
 		 367 aa  55.1  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0932  pyruvyl-transferase  24.69 
 
 		 362 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.277719  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0973  CsaB protein  21.94 
 
 		 367 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0112574 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0788  pyruvyl-transferase  22.22 
 
 		 367 aa  53.5  0.000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.192045  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1063  CsaB protein  22.03 
 
 		 367 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000585392  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2096  polysaccharide pyruvyl transferase  26.32 
 
 		 388 aa  51.2  0.00003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2702  polysaccharide pyruvyl transferase  24.51 
 
 		 745 aa  50.1  0.00007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000746297  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0972  CsaB protein  23.46 
 
 		 369 aa  50.1  0.00007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.953296  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3975  polysaccharide pyruvyl transferase  27.72 
 
 		 1225 aa  48.1  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.584875 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3117  polysaccharide pyruvyl transferase  25.08 
 
 		 370 aa  47  0.0006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.030522  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3253  putative polysaccharide pyruvyl transferase  20.94 
 
 		 381 aa  46.2  0.0009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.151053  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1408  polysaccharide pyruvyl transferase  31.17 
 
 		 341 aa  45.8  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000381534  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1589  hypothetical protein  23 
 
 		 357 aa  45.8  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.426029  normal  0.0528272 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3383  polysaccharide pyruvyl transferase  24.11 
 
 		 408 aa  44.7  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4136  polysaccharide pyruvyl transferase  27.41 
 
 		 394 aa  44.3  0.004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.920771 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3792  response regulator receiver domain-containing protein  34.48 
 
 		 359 aa  44.3  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0956  polysaccharide pyruvyl transferase  30.11 
 
 		 407 aa  43.9  0.005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.383692  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0419  hypothetical protein  33.33 
 
 		 413 aa  42.7  0.01  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>