22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_p840_04 on replicon NC_011311
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011311  VSAL_p840_04  conjugative transfer protein TraE  100 
 
 		 186 aa  370  1e-102  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4374  type IV conjugative transfer system protein TraE  50 
 
 		 188 aa  193  2e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.23647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4539  type IV conjugative transfer system protein TraE  50 
 
 		 188 aa  193  2e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.369103  normal  0.416907 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4442  type IV conjugative transfer system protein TraE  50 
 
 		 188 aa  191  4e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4631  type IV conjugative transfer system protein TraE  51.1 
 
 		 188 aa  191  5e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.802184 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4498  type IV conjugative transfer system protein TraE  49.45 
 
 		 188 aa  191  7e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4446  TraE family protein  50 
 
 		 188 aa  190  1e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.622638  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0037  conjugal transfer pilus assembly protein TraE  31.33 
 
 		 188 aa  64.7  0.0000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0016  hypothetical protein  26.34 
 
 		 189 aa  62.8  0.000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.813355  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0024  hypothetical protein  26.44 
 
 		 185 aa  62  0.000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0257  putative sex pilus assembly and synthesis protein  27.78 
 
 		 192 aa  60.1  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.788798  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0320  conserved hypothetical sex pilus assembly and synthesis protein  28.74 
 
 		 192 aa  58.5  0.00000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0075  conjugal transfer pilus assembly protein TraE  28.95 
 
 		 187 aa  57.8  0.00000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2315  plasmid-like conjugative transfer protein TraE  24.7 
 
 		 188 aa  54.7  0.0000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2648  plasmid-like conjugative transfer protein TraE  24.86 
 
 		 188 aa  53.9  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1540  plasmid-like conjugative transfer protein TraE  26.73 
 
 		 188 aa  50.1  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.475003  normal  0.191593 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4183  hypothetical protein  22.88 
 
 		 197 aa  48.1  0.00007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.0000132578  hitchhiker  0.0000422379 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_4011  TraE family protein  24.32 
 
 		 207 aa  45.1  0.0006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.57449  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6792  hypothetical protein  22.29 
 
 		 203 aa  44.3  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4285  TraE family protein  24.71 
 
 		 193 aa  42.7  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2157  hypothetical protein  24.43 
 
 		 190 aa  42  0.005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0365  sex pilus assembly protein  26.09 
 
 		 213 aa  40.8  0.01  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0623018  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>