26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_2315 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_2315  plasmid-like conjugative transfer protein TraE  100 
 
 		 188 aa  382  1e-105  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2648  plasmid-like conjugative transfer protein TraE  96.28 
 
 		 188 aa  372  1e-102  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1540  plasmid-like conjugative transfer protein TraE  79.78 
 
 		 188 aa  295  2e-79  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.475003  normal  0.191593 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4183  hypothetical protein  27.87 
 
 		 197 aa  80.5  0.00000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.0000132578  hitchhiker  0.0000422379 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3781  putative sex pilus assembly and synthesis protein  25.75 
 
 		 199 aa  69.3  0.00000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.271719  n/a   
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4631  type IV conjugative transfer system protein TraE  28.66 
 
 		 188 aa  68.6  0.00000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.802184 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4446  TraE family protein  28.05 
 
 		 188 aa  67.8  0.00000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.622638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0075  conjugal transfer pilus assembly protein TraE  29.59 
 
 		 187 aa  67.4  0.0000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0320  conserved hypothetical sex pilus assembly and synthesis protein  24.53 
 
 		 192 aa  65.5  0.0000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4539  type IV conjugative transfer system protein TraE  27.44 
 
 		 188 aa  65.5  0.0000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.369103  normal  0.416907 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4374  type IV conjugative transfer system protein TraE  27.44 
 
 		 188 aa  65.5  0.0000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.23647  normal  1 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4442  type IV conjugative transfer system protein TraE  27.44 
 
 		 188 aa  65.5  0.0000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4498  type IV conjugative transfer system protein TraE  27.44 
 
 		 188 aa  64.7  0.0000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6792  hypothetical protein  28.68 
 
 		 203 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0257  putative sex pilus assembly and synthesis protein  25 
 
 		 192 aa  61.2  0.000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.788798  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0037  conjugal transfer pilus assembly protein TraE  32.5 
 
 		 188 aa  57  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2157  hypothetical protein  30.23 
 
 		 190 aa  56.6  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5366  TraE family protein  26.97 
 
 		 188 aa  55.1  0.0000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.163981 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4285  TraE family protein  29.52 
 
 		 193 aa  54.7  0.0000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1079  type IV conjugative transfer system protein TraE  25.95 
 
 		 204 aa  54.7  0.0000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.360981  n/a   
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_04  conjugative transfer protein TraE  24.7 
 
 		 186 aa  54.7  0.0000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_4011  TraE family protein  22.28 
 
 		 207 aa  51.6  0.000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.57449  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0930  putative conjugative transfer protein TraE  34.44 
 
 		 192 aa  49.3  0.00003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0844234  n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0016  hypothetical protein  23.63 
 
 		 189 aa  46.2  0.0003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.813355  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0074  type IV conjugative transfer system protein TraE  23.17 
 
 		 208 aa  45.4  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0365  sex pilus assembly protein  27.34 
 
 		 213 aa  44.7  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0623018  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>