19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_A0037 on replicon NC_010488
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010488  EcSMS35_A0037  conjugal transfer pilus assembly protein TraE  100 
 
 		 188 aa  389  1e-107  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0075  conjugal transfer pilus assembly protein TraE  46.81 
 
 		 187 aa  176  2e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4285  TraE family protein  33.87 
 
 		 193 aa  92.4  3e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0016  hypothetical protein  34.15 
 
 		 189 aa  82  0.000000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.813355  n/a   
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4498  type IV conjugative transfer system protein TraE  34.35 
 
 		 188 aa  73.9  0.000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4374  type IV conjugative transfer system protein TraE  34.35 
 
 		 188 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.23647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4539  type IV conjugative transfer system protein TraE  34.35 
 
 		 188 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.369103  normal  0.416907 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4442  type IV conjugative transfer system protein TraE  33.59 
 
 		 188 aa  72.8  0.000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4446  TraE family protein  34.35 
 
 		 188 aa  72.4  0.000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.622638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4631  type IV conjugative transfer system protein TraE  33.59 
 
 		 188 aa  71.6  0.000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.802184 
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_04  conjugative transfer protein TraE  31.33 
 
 		 186 aa  64.7  0.0000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1540  plasmid-like conjugative transfer protein TraE  31.67 
 
 		 188 aa  58.2  0.00000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.475003  normal  0.191593 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4183  hypothetical protein  30.56 
 
 		 197 aa  58.2  0.00000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.0000132578  hitchhiker  0.0000422379 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2648  plasmid-like conjugative transfer protein TraE  32.5 
 
 		 188 aa  57.4  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2315  plasmid-like conjugative transfer protein TraE  32.5 
 
 		 188 aa  57  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0024  hypothetical protein  25.16 
 
 		 185 aa  53.9  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0257  putative sex pilus assembly and synthesis protein  26.06 
 
 		 192 aa  53.5  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.788798  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0320  conserved hypothetical sex pilus assembly and synthesis protein  26.97 
 
 		 192 aa  53.5  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0930  putative conjugative transfer protein TraE  24.82 
 
 		 192 aa  42.7  0.003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0844234  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>