20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene plpl0016 on replicon NC_006366
Organism: Legionella pneumophila str. Lens



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006366  plpl0016  hypothetical protein  100 
 
 		 189 aa  389  1e-107  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.813355  n/a   
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4498  type IV conjugative transfer system protein TraE  30.54 
 
 		 188 aa  92  5e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4374  type IV conjugative transfer system protein TraE  29.94 
 
 		 188 aa  91.3  7e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.23647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4539  type IV conjugative transfer system protein TraE  29.94 
 
 		 188 aa  91.3  7e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.369103  normal  0.416907 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4442  type IV conjugative transfer system protein TraE  30.54 
 
 		 188 aa  91.3  8e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4446  TraE family protein  29.34 
 
 		 188 aa  87.8  8e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.622638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4631  type IV conjugative transfer system protein TraE  29.34 
 
 		 188 aa  85.9  3e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.802184 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0037  conjugal transfer pilus assembly protein TraE  34.15 
 
 		 188 aa  82  0.000000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0075  conjugal transfer pilus assembly protein TraE  31.39 
 
 		 187 aa  68.9  0.00000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_04  conjugative transfer protein TraE  26.34 
 
 		 186 aa  62.8  0.000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4285  TraE family protein  28.57 
 
 		 193 aa  55.1  0.0000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4183  hypothetical protein  26.58 
 
 		 197 aa  50.1  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.0000132578  hitchhiker  0.0000422379 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2157  hypothetical protein  25.19 
 
 		 190 aa  50.4  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0024  hypothetical protein  26.67 
 
 		 185 aa  48.5  0.00005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2315  plasmid-like conjugative transfer protein TraE  23.63 
 
 		 188 aa  46.2  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2648  plasmid-like conjugative transfer protein TraE  25.14 
 
 		 188 aa  45.8  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5366  TraE family protein  24 
 
 		 188 aa  45.4  0.0005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.163981 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3781  putative sex pilus assembly and synthesis protein  22.46 
 
 		 199 aa  44.3  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.271719  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1540  plasmid-like conjugative transfer protein TraE  26.32 
 
 		 188 aa  44.3  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.475003  normal  0.191593 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0320  conserved hypothetical sex pilus assembly and synthesis protein  21.67 
 
 		 192 aa  43.5  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>