16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene plpp0024 on replicon NC_006365
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006365  plpp0024  hypothetical protein  100 
 
 
185 aa  382  1e-105  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_04  conjugative transfer protein TraE  26.44 
 
 
186 aa  62  0.000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0037  conjugal transfer pilus assembly protein TraE  25.16 
 
 
188 aa  53.9  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4446  TraE family protein  22.16 
 
 
188 aa  50.4  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.622638  normal 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4631  type IV conjugative transfer system protein TraE  22.16 
 
 
188 aa  49.7  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.802184 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4498  type IV conjugative transfer system protein TraE  22.16 
 
 
188 aa  50.1  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4539  type IV conjugative transfer system protein TraE  22.16 
 
 
188 aa  49.3  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.369103  normal  0.416907 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4374  type IV conjugative transfer system protein TraE  22.16 
 
 
188 aa  49.3  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.23647  normal 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4442  type IV conjugative transfer system protein TraE  22.16 
 
 
188 aa  49.3  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0075  conjugal transfer pilus assembly protein TraE  25 
 
 
187 aa  49.3  0.00004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0016  hypothetical protein  26.67 
 
 
189 aa  48.5  0.00005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.813355  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0320  conserved hypothetical sex pilus assembly and synthesis protein  26.04 
 
 
192 aa  48.5  0.00005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0257  putative sex pilus assembly and synthesis protein  22.29 
 
 
192 aa  47  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.788798  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6792  hypothetical protein  21.82 
 
 
203 aa  45.8  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4183  hypothetical protein  23.2 
 
 
197 aa  45.8  0.0004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.0000132578  hitchhiker  0.0000422379 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1540  plasmid-like conjugative transfer protein TraE  21.77 
 
 
188 aa  42.7  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.475003  normal  0.191593 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>