17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_6792 on replicon NC_008545
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008545  Bcen2424_6792  hypothetical protein  100 
 
 		 203 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4183  hypothetical protein  40.64 
 
 		 197 aa  126  2.0000000000000002e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.0000132578  hitchhiker  0.0000422379 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1540  plasmid-like conjugative transfer protein TraE  31.3 
 
 		 188 aa  65.1  0.0000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.475003  normal  0.191593 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2315  plasmid-like conjugative transfer protein TraE  28.68 
 
 		 188 aa  63.9  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2648  plasmid-like conjugative transfer protein TraE  29.46 
 
 		 188 aa  63.2  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0257  putative sex pilus assembly and synthesis protein  26.6 
 
 		 192 aa  61.6  0.000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.788798  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0075  conjugal transfer pilus assembly protein TraE  25.42 
 
 		 187 aa  58.2  0.00000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0320  conserved hypothetical sex pilus assembly and synthesis protein  25.42 
 
 		 192 aa  57.8  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4498  type IV conjugative transfer system protein TraE  28.44 
 
 		 188 aa  53.5  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4442  type IV conjugative transfer system protein TraE  27.52 
 
 		 188 aa  50.8  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4631  type IV conjugative transfer system protein TraE  23.93 
 
 		 188 aa  50.8  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.802184 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4539  type IV conjugative transfer system protein TraE  26.61 
 
 		 188 aa  50.4  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.369103  normal  0.416907 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4446  TraE family protein  26.61 
 
 		 188 aa  50.4  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.622638  normal  1 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4374  type IV conjugative transfer system protein TraE  26.61 
 
 		 188 aa  50.4  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.23647  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0024  hypothetical protein  21.82 
 
 		 185 aa  45.8  0.0005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_04  conjugative transfer protein TraE  22.29 
 
 		 186 aa  44.3  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4285  TraE family protein  24.52 
 
 		 193 aa  44.3  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>