16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_4011 on replicon NC_009426
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009426  Saro_4011  TraE family protein  100 
 
 		 207 aa  424  1e-118  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.57449  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5366  TraE family protein  58.06 
 
 		 188 aa  235  3e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.163981 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2157  hypothetical protein  54.34 
 
 		 190 aa  196  2.0000000000000003e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0075  conjugal transfer pilus assembly protein TraE  24 
 
 		 187 aa  52  0.000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2315  plasmid-like conjugative transfer protein TraE  22.28 
 
 		 188 aa  51.6  0.000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1540  plasmid-like conjugative transfer protein TraE  24.64 
 
 		 188 aa  51.6  0.000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.475003  normal  0.191593 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4498  type IV conjugative transfer system protein TraE  22 
 
 		 188 aa  48.1  0.00009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4539  type IV conjugative transfer system protein TraE  22 
 
 		 188 aa  47.8  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.369103  normal  0.416907 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4374  type IV conjugative transfer system protein TraE  22 
 
 		 188 aa  47.8  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.23647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4446  TraE family protein  22 
 
 		 188 aa  47.4  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.622638  normal  1 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4442  type IV conjugative transfer system protein TraE  22 
 
 		 188 aa  47.4  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4631  type IV conjugative transfer system protein TraE  22.67 
 
 		 188 aa  46.6  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.802184 
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_04  conjugative transfer protein TraE  24.32 
 
 		 186 aa  45.1  0.0008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0320  conserved hypothetical sex pilus assembly and synthesis protein  23.18 
 
 		 192 aa  44.3  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0257  putative sex pilus assembly and synthesis protein  22.67 
 
 		 192 aa  43.5  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.788798  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4221  hypothetical protein  22.36 
 
 		 184 aa  41.2  0.01  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>