29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_07115 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_07115  hypothetical protein  100 
 
 		 1164 aa  2335    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2782  Ig domain protein group 1 domain protein  32.58 
 
 		 4672 aa  179  2e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.117201 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3359  Ig family protein  27.19 
 
 		 1084 aa  101  7e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07116  hypothetical protein  30.39 
 
 		 330 aa  101  8e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4024  putative invasin  27.08 
 
 		 2933 aa  81.3  0.0000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.43506  normal  0.407201 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1315  Ig domain-containing protein  28.42 
 
 		 1976 aa  77.4  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.454335  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0608  putative invasin  27.66 
 
 		 2795 aa  75.1  0.000000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1994  invasin domain-containing protein  30.48 
 
 		 690 aa  69.3  0.0000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2429  invasin region 3  30.11 
 
 		 969 aa  67.8  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.621215  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4562  hypothetical protein  33.33 
 
 		 549 aa  68.2  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.47968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2329  invasin  30.11 
 
 		 941 aa  67.4  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.942783  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0529  Ig domain-containing protein  27.74 
 
 		 3209 aa  66.2  0.000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000000708998 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0351  putative invasin  25.09 
 
 		 1417 aa  60.5  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4008  putative invasin  25.95 
 
 		 4953 aa  60.1  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0331  putative invasin  24.87 
 
 		 1417 aa  59.3  0.0000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0145  hypothetical protein  26.77 
 
 		 5337 aa  56.6  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3322  Ig domain-containing protein  24.16 
 
 		 1418 aa  55.1  0.000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0312  EaeH  24.52 
 
 		 1396 aa  54.7  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0351  putative intimin  24.78 
 
 		 1417 aa  54.3  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.751888  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5054  intimin C-type lectin domain protein  26.92 
 
 		 934 aa  53.5  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4876  putative invasin  24.66 
 
 		 1746 aa  53.1  0.00003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.847065  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01881  hypothetical protein  24.5 
 
 		 2367 aa  51.6  0.00008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0890809  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01891  adhesin  24.5 
 
 		 2383 aa  51.6  0.00008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0926069  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1146  putative invasin  22.99 
 
 		 2358 aa  50.4  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0236559  hitchhiker  0.00000000373637 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1674  Ig domain protein group 1 domain protein  24.31 
 
 		 2358 aa  49.7  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2261  putative invasin  22.99 
 
 		 2296 aa  49.3  0.0005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000213417  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0983  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  26.32 
 
 		 1147 aa  45.8  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.657675  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3850  helicase domain-containing protein  26.47 
 
 		 1285 aa  45.4  0.007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0175478 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4116  hypothetical protein  23.53 
 
 		 2933 aa  45.1  0.009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.863096 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>