31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_05832 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_05976  hypothetical protein  89.72 
 
 
850 aa  1528    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05832  peptidase  100 
 
 
847 aa  1741    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05990  hypothetical protein  86.91 
 
 
857 aa  1457    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01641  hypothetical protein  31.42 
 
 
896 aa  275  3e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04723  hypothetical protein  56.95 
 
 
148 aa  166  1.0000000000000001e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3534  hypothetical protein  40.31 
 
 
244 aa  125  4e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3364  hypothetical protein  41.42 
 
 
244 aa  123  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0589  hypothetical protein  41.42 
 
 
244 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2711  hypothetical protein  26.79 
 
 
965 aa  78.6  0.0000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4398  Ig domain-containing protein  33.9 
 
 
1316 aa  77.8  0.0000000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0506972  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0614  Ig domain-containing protein  29.41 
 
 
980 aa  77  0.000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.488715 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0587  Ig domain-containing protein  29.07 
 
 
980 aa  73.9  0.00000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0618  Ig domain protein group 1 domain protein  28.47 
 
 
980 aa  71.2  0.00000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0595  Ig domain-containing protein  27.84 
 
 
974 aa  68.2  0.0000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0622  Ig domain-containing protein  27.84 
 
 
974 aa  68.2  0.0000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.152382 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0591  hypothetical protein  28.62 
 
 
1010 aa  67.8  0.0000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0588  Ig domain-containing protein  24.09 
 
 
968 aa  67.4  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0615  Ig domain-containing protein  24.09 
 
 
968 aa  67.4  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0498521  normal  0.318531 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0619  Ig domain protein group 1 domain protein  24.09 
 
 
968 aa  67  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0627  Ig domain protein group 1 domain protein  28.18 
 
 
979 aa  67  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1872  putative lipoprotein  23.77 
 
 
1422 aa  50.1  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2308  hypothetical protein  20.57 
 
 
962 aa  47.8  0.0009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0419846 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01881  hypothetical protein  28.48 
 
 
2367 aa  47  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0890809  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2821  hypothetical protein  29.09 
 
 
2620 aa  47.8  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0867101  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01891  adhesin  28.48 
 
 
2383 aa  47  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0926069  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1674  Ig domain protein group 1 domain protein  28.48 
 
 
2358 aa  47  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2261  putative invasin  28.95 
 
 
2296 aa  45.8  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000213417  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0115  putative lipoprotein  25.69 
 
 
1410 aa  46.2  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0112  putative lipoprotein  25.69 
 
 
1410 aa  46.2  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0110  putative lipoprotein  25.69 
 
 
1408 aa  46.2  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1146  putative invasin  30.26 
 
 
2358 aa  44.3  0.01  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0236559  hitchhiker  0.00000000373637 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>