69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_04953 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_04953  flagellar hook-length control protein  100 
 
 		 351 aa  702    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001169  flagellar hook-length control protein FliK  63.85 
 
 		 357 aa  295  6e-79  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.272814  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3583  flagellar hook-length control protein  41.45 
 
 		 334 aa  110  2.0000000000000002e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0189  flagellar hook-length control protein  46.39 
 
 		 352 aa  94  3e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.511537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0059  flagellar hook-length control protein  31.51 
 
 		 390 aa  89  1e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0053  hypothetical protein  35.38 
 
 		 383 aa  88.2  2e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3635  flagellar hook-length control protein  35.94 
 
 		 438 aa  86.3  8e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.225852  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3451  flagellar hook-length control protein  38.94 
 
 		 393 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3952  flagellar hook-length control protein  36.57 
 
 		 395 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.253491  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0204  flagellar hook-length control protein  37.21 
 
 		 361 aa  75.5  0.000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.504865 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0658  flagellar hook-length control protein  36.72 
 
 		 365 aa  74.7  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3354  flagellar hook-length control protein  39.58 
 
 		 353 aa  70.1  0.00000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.26505  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0280  lateral flagellar hook length control protein LafE  38.54 
 
 		 353 aa  68.9  0.0000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00112639  normal  0.832846 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1287  flagellar hook-length control protein  39.6 
 
 		 586 aa  67.4  0.0000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1354  flagellar hook-length control protein  39.6 
 
 		 585 aa  67.4  0.0000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2571  flagellar hook-length control protein  33.87 
 
 		 491 aa  65.5  0.000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0493  flagellar hook-length control protein  41.38 
 
 		 460 aa  64.7  0.000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3223  flagellar hook-length control protein FliK  39.13 
 
 		 527 aa  65.1  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1347  flagellar hook-length control protein  37.62 
 
 		 579 aa  64.3  0.000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.371823 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2354  flagellar hook-length control protein  40.21 
 
 		 487 aa  62.4  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45830  hypothetical protein  38.71 
 
 		 427 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3888  hypothetical protein  39.33 
 
 		 428 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.669233  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0231  flagellar hook-length control protein, putative  34.34 
 
 		 380 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1371  flagellar hook-length control protein  39.74 
 
 		 568 aa  58.5  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.358506  normal  0.685511 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1187  flagellar hook-length control protein  33.02 
 
 		 512 aa  57.8  0.0000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0179  flagellar hook-length control protein, putative  34.21 
 
 		 381 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.501207  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3063  flagellar hook-length control protein  30.83 
 
 		 718 aa  57.4  0.0000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.954903  normal  0.750482 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1442  flagellar hook-length control protein  30.83 
 
 		 702 aa  57.4  0.0000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.822312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1989  flagellar hook-length control protein  34 
 
 		 394 aa  56.6  0.0000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1366  flagellar hook-length control protein  34.26 
 
 		 508 aa  56.2  0.0000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2817  flagellar hook-length control protein  38.95 
 
 		 408 aa  56.2  0.0000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0900744 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0714  flagellar hook-length control protein  43.04 
 
 		 369 aa  55.8  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2931  flagellar hook-length control protein  36.78 
 
 		 717 aa  55.8  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1711  putative flagellar hook-length control protein FliK  37.66 
 
 		 674 aa  55.8  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1964  Flagellar hook-length control protein-like protein  41.56 
 
 		 324 aa  55.8  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.727762  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2921  flagellar hook-length control protein  38.46 
 
 		 537 aa  55.8  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1623  flagellar hook-length control protein  36.56 
 
 		 544 aa  54.7  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3686  flagellar hook-length control protein  37.21 
 
 		 435 aa  53.5  0.000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.373199  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4361  flagellar hook-length control protein  37.21 
 
 		 421 aa  53.5  0.000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.446802 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2292  flagellar hook-length control protein FliK  32.23 
 
 		 593 aa  53.5  0.000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.755689 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1506  flagellar hook-length control protein  37.21 
 
 		 421 aa  53.1  0.000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.374735  normal  0.0562001 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3922  flagellar hook-length control protein  37.21 
 
 		 421 aa  53.5  0.000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3061  flagellar hook-length control protein  31.71 
 
 		 609 aa  53.1  0.000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.15551  normal  0.0461289 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1329  flagellar hook-length control protein  28.68 
 
 		 495 aa  52.8  0.000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.214505  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1657  hypothetical protein  27.27 
 
 		 414 aa  52.8  0.000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1651  hypothetical protein  27.27 
 
 		 420 aa  51.6  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3916  flagellar hook-length control protein  33.72 
 
 		 656 aa  49.3  0.00009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.108844 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1163  flagellar hook-length control protein  36.63 
 
 		 364 aa  49.3  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.193048  normal  0.0180974 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1966  flagellar hook-length control protein FliK  33.72 
 
 		 474 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.471768  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3449  flagellar hook-length control protein  33.72 
 
 		 467 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.715571 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2905  flagellar hook-length control protein  36.62 
 
 		 478 aa  48.5  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1544  flagellar hook-length control protein  37.78 
 
 		 453 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.213285  normal  0.574566 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1507  putative flagellar hook-length control protein  32.53 
 
 		 660 aa  48.1  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.838135  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1875  flagellar hook-length control protein  32.5 
 
 		 389 aa  47.4  0.0004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.521735  normal  0.436582 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02883  polar flagellar hook-length control protein FliK  40 
 
 		 768 aa  47  0.0004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0438685  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00976  flagellar protein  32 
 
 		 434 aa  47  0.0005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.113548  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06190  flagellar protein  32 
 
 		 434 aa  47  0.0005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0480838  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2303  polar flagellar hook-length control protein FliK  30 
 
 		 407 aa  46.6  0.0006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3106  flagellar hook-length control protein  33.67 
 
 		 479 aa  45.4  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2177  flagellar hook-length control protein-like  28.42 
 
 		 485 aa  45.8  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.025521  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002820  flagellar hook-length control protein FliK  31.94 
 
 		 623 aa  45.8  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3432  flagellar hook-length control protein  31.52 
 
 		 570 aa  45.8  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3439  flagellar hook-length control protein  34.58 
 
 		 567 aa  44.7  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0416  hypothetical protein  31 
 
 		 479 aa  45.1  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3572  flagellar hook-length control protein  30 
 
 		 367 aa  44.3  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.949278 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0575  flagellar hook-length control protein  33.98 
 
 		 552 aa  44.3  0.004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1437  flagellar hook-length control protein  34.21 
 
 		 650 aa  43.5  0.005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03156  hypothetical protein  30.88 
 
 		 686 aa  43.5  0.006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3832  flagellar hook-length control protein  27.27 
 
 		 660 aa  43.1  0.007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>