74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_3635 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_3635  flagellar hook-length control protein  100 
 
 		 438 aa  877    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.225852  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3952  flagellar hook-length control protein  55.21 
 
 		 395 aa  177  3e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.253491  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0059  flagellar hook-length control protein  66.09 
 
 		 390 aa  172  1e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0053  hypothetical protein  49.46 
 
 		 383 aa  169  1e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3451  flagellar hook-length control protein  59.56 
 
 		 393 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04953  flagellar hook-length control protein  35.94 
 
 		 351 aa  86.3  0.000000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001169  flagellar hook-length control protein FliK  40.78 
 
 		 357 aa  81.6  0.00000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.272814  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3583  flagellar hook-length control protein  32.06 
 
 		 334 aa  73.6  0.000000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0204  flagellar hook-length control protein  31.03 
 
 		 361 aa  67  0.0000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.504865 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1964  Flagellar hook-length control protein-like protein  41.46 
 
 		 324 aa  66.6  0.0000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.727762  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0189  flagellar hook-length control protein  42.53 
 
 		 352 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.511537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0658  flagellar hook-length control protein  31.88 
 
 		 365 aa  65.1  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3063  flagellar hook-length control protein  42.35 
 
 		 718 aa  64.3  0.000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.954903  normal  0.750482 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1442  flagellar hook-length control protein  42.35 
 
 		 702 aa  64.3  0.000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.822312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2921  flagellar hook-length control protein  43.84 
 
 		 537 aa  64.3  0.000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2931  flagellar hook-length control protein  42.35 
 
 		 717 aa  64.3  0.000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1187  flagellar hook-length control protein  45.59 
 
 		 512 aa  64.3  0.000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3223  flagellar hook-length control protein FliK  42.35 
 
 		 527 aa  63.5  0.000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2571  flagellar hook-length control protein  42.47 
 
 		 491 aa  63.2  0.000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1623  flagellar hook-length control protein  41.18 
 
 		 544 aa  62  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1347  flagellar hook-length control protein  41.1 
 
 		 579 aa  61.2  0.00000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.371823 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1354  flagellar hook-length control protein  41.1 
 
 		 585 aa  60.8  0.00000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1287  flagellar hook-length control protein  41.43 
 
 		 586 aa  60.5  0.00000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2354  flagellar hook-length control protein  37.21 
 
 		 487 aa  60.5  0.00000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1711  putative flagellar hook-length control protein FliK  37.5 
 
 		 674 aa  60.1  0.00000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1371  flagellar hook-length control protein  38.75 
 
 		 568 aa  59.3  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.358506  normal  0.685511 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3888  hypothetical protein  44.78 
 
 		 428 aa  57.4  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.669233  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45830  hypothetical protein  44.78 
 
 		 427 aa  57.4  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1163  flagellar hook-length control protein  37.63 
 
 		 364 aa  56.6  0.0000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.193048  normal  0.0180974 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00976  flagellar protein  42.19 
 
 		 434 aa  55.8  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.113548  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06190  flagellar protein  42.19 
 
 		 434 aa  55.8  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0480838  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0280  lateral flagellar hook length control protein LafE  38.89 
 
 		 353 aa  55.5  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00112639  normal  0.832846 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3354  flagellar hook-length control protein  39.77 
 
 		 353 aa  55.5  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.26505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03156  hypothetical protein  35.29 
 
 		 686 aa  55.5  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2303  polar flagellar hook-length control protein FliK  34.85 
 
 		 407 aa  55.1  0.000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1875  flagellar hook-length control protein  41.56 
 
 		 389 aa  54.3  0.000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.521735  normal  0.436582 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1329  flagellar hook-length control protein  37.5 
 
 		 495 aa  54.3  0.000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.214505  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1366  flagellar hook-length control protein  33.33 
 
 		 508 aa  53.9  0.000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02883  polar flagellar hook-length control protein FliK  32.14 
 
 		 768 aa  53.1  0.000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0438685  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2817  flagellar hook-length control protein  47.06 
 
 		 408 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0900744 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1989  flagellar hook-length control protein  44.78 
 
 		 394 aa  52.8  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002820  flagellar hook-length control protein FliK  34.85 
 
 		 623 aa  52.4  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0714  flagellar hook-length control protein  46.77 
 
 		 369 aa  51.6  0.00003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2292  flagellar hook-length control protein FliK  36.71 
 
 		 593 aa  51.6  0.00003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.755689 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0493  flagellar hook-length control protein  31.37 
 
 		 460 aa  51.2  0.00003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3439  flagellar hook-length control protein  44.3 
 
 		 567 aa  50.4  0.00006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1544  flagellar hook-length control protein  30.65 
 
 		 453 aa  50.4  0.00007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.213285  normal  0.574566 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3916  flagellar hook-length control protein  36.76 
 
 		 656 aa  49.3  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.108844 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0179  flagellar hook-length control protein, putative  32.94 
 
 		 381 aa  49.3  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.501207  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1966  flagellar hook-length control protein FliK  33.33 
 
 		 474 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.471768  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2905  flagellar hook-length control protein  40.62 
 
 		 478 aa  49.7  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0231  flagellar hook-length control protein, putative  35 
 
 		 380 aa  48.5  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3449  flagellar hook-length control protein  33.33 
 
 		 467 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.715571 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1507  putative flagellar hook-length control protein  28.57 
 
 		 660 aa  48.5  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.838135  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2177  flagellar hook-length control protein-like  35.06 
 
 		 485 aa  48.9  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.025521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3061  flagellar hook-length control protein  40 
 
 		 609 aa  48.1  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.15551  normal  0.0461289 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2534  flagellar hook-length control protein  34.65 
 
 		 407 aa  48.1  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.658569 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0416  hypothetical protein  41.18 
 
 		 479 aa  47.8  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0690  flagellar hook-length control protein  38.24 
 
 		 641 aa  47.8  0.0004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.464695 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3106  flagellar hook-length control protein  43.14 
 
 		 479 aa  47.4  0.0005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3432  flagellar hook-length control protein  36.92 
 
 		 570 aa  47.4  0.0006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1886  flagellar hook-length control protein  40.38 
 
 		 430 aa  47  0.0007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3832  flagellar hook-length control protein  39.58 
 
 		 660 aa  45.1  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2580  flagellar hook-length control protein  38.46 
 
 		 431 aa  44.7  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.549964  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2132  flagellar hook-length control protein  30.84 
 
 		 407 aa  44.3  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.151481 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1145  flagellar hook-length control protein  30.84 
 
 		 407 aa  44.3  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.475671  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2137  flagellar hook-length control protein  30.84 
 
 		 407 aa  44.3  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000644258 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3686  flagellar hook-length control protein  34.62 
 
 		 435 aa  44.3  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.373199  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3922  flagellar hook-length control protein  34.62 
 
 		 421 aa  43.9  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4361  flagellar hook-length control protein  34.62 
 
 		 421 aa  43.9  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.446802 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2190  flagellar hook-length control protein  40.38 
 
 		 405 aa  43.9  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.543478 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1268  flagellar hook-length control protein  40.38 
 
 		 405 aa  43.9  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1506  flagellar hook-length control protein  34.62 
 
 		 421 aa  43.9  0.006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.374735  normal  0.0562001 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2719  flagellar hook-length control protein  38.46 
 
 		 375 aa  43.5  0.008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.243255  normal  0.82206 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>