24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_3106 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_3106  flagellar hook-length control protein  100 
 
 		 479 aa  943    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0416  hypothetical protein  47.13 
 
 		 479 aa  229  1e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3916  flagellar hook-length control protein  34.51 
 
 		 656 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.108844 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4207  flagellar hook-length control protein  44.22 
 
 		 604 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3832  flagellar hook-length control protein  43.45 
 
 		 660 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3432  flagellar hook-length control protein  34.87 
 
 		 570 aa  96.7  8e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3298  flagellar hook-length control protein  41.98 
 
 		 602 aa  73.6  0.000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1186  putative flagellar hook-length control protein  25.89 
 
 		 580 aa  51.2  0.00004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3635  flagellar hook-length control protein  34.21 
 
 		 438 aa  47.8  0.0004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.225852  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1397  flagellar hook-length control protein  25.97 
 
 		 637 aa  47.4  0.0006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.761037  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1544  flagellar hook-length control protein  38.71 
 
 		 453 aa  46.6  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.213285  normal  0.574566 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04953  flagellar hook-length control protein  33.67 
 
 		 351 aa  46.2  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0471  flagellar hook-length control protein  30.43 
 
 		 528 aa  45.8  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0059  flagellar hook-length control protein  30.23 
 
 		 390 aa  45.4  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1656  flagellar hook-length control protein  28.3 
 
 		 663 aa  45.4  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.410936  normal  0.453222 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1989  flagellar hook-length control protein  36.36 
 
 		 394 aa  45.1  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1117  flagellar hook-length control protein  29.29 
 
 		 407 aa  45.1  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2817  flagellar hook-length control protein  34.43 
 
 		 408 aa  44.3  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0900744 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1966  flagellar hook-length control protein FliK  30.53 
 
 		 474 aa  44.3  0.006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.471768  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3888  hypothetical protein  32.79 
 
 		 428 aa  43.9  0.007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.669233  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45830  hypothetical protein  32.79 
 
 		 427 aa  43.9  0.007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3952  flagellar hook-length control protein  27.17 
 
 		 395 aa  43.5  0.008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.253491  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3686  flagellar hook-length control protein  38.71 
 
 		 435 aa  43.1  0.01  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.373199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3572  flagellar hook-length control protein  27.03 
 
 		 367 aa  43.1  0.01  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.949278 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>