20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_0280 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_0280  lateral flagellar hook length control protein LafE  100 
 
 		 353 aa  693    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00112639  normal  0.832846 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3354  flagellar hook-length control protein  97.45 
 
 		 353 aa  630  1e-179  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.26505  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0204  flagellar hook-length control protein  37.74 
 
 		 361 aa  93.6  5e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.504865 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0189  flagellar hook-length control protein  48.31 
 
 		 352 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.511537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0658  flagellar hook-length control protein  41.01 
 
 		 365 aa  88.2  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001169  flagellar hook-length control protein FliK  35.46 
 
 		 357 aa  79  0.0000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.272814  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04953  flagellar hook-length control protein  37.39 
 
 		 351 aa  77  0.0000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3583  flagellar hook-length control protein  33.93 
 
 		 334 aa  74.3  0.000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0231  flagellar hook-length control protein, putative  36.45 
 
 		 380 aa  66.2  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3635  flagellar hook-length control protein  32.8 
 
 		 438 aa  63.2  0.000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.225852  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0179  flagellar hook-length control protein, putative  37.65 
 
 		 381 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.501207  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0059  flagellar hook-length control protein  37.21 
 
 		 390 aa  58.5  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4663  flagellar hook-length control protein  31.93 
 
 		 390 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.180097 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3952  flagellar hook-length control protein  26.27 
 
 		 395 aa  55.1  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.253491  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0053  hypothetical protein  31.46 
 
 		 383 aa  53.5  0.000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2354  flagellar hook-length control protein  34.34 
 
 		 487 aa  52.4  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3451  flagellar hook-length control protein  28.57 
 
 		 393 aa  48.9  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1964  Flagellar hook-length control protein-like protein  29.71 
 
 		 324 aa  48.1  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.727762  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1656  flagellar hook-length control protein  33.33 
 
 		 663 aa  47.4  0.0004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.410936  normal  0.453222 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3916  flagellar hook-length control protein  26.05 
 
 		 656 aa  43.5  0.006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.108844 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>