68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_3952 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009052  Sbal_3952  flagellar hook-length control protein  100 
 
 		 395 aa  788    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.253491  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3451  flagellar hook-length control protein  69.17 
 
 		 393 aa  498  1e-140  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0053  hypothetical protein  52.33 
 
 		 383 aa  182  7e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0059  flagellar hook-length control protein  57.62 
 
 		 390 aa  181  2e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3635  flagellar hook-length control protein  55.21 
 
 		 438 aa  177  3e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.225852  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04953  flagellar hook-length control protein  36.57 
 
 		 351 aa  84.7  0.000000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001169  flagellar hook-length control protein FliK  31.65 
 
 		 357 aa  77.4  0.0000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.272814  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3583  flagellar hook-length control protein  29.37 
 
 		 334 aa  70.9  0.00000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1371  flagellar hook-length control protein  33.86 
 
 		 568 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.358506  normal  0.685511 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0189  flagellar hook-length control protein  38.14 
 
 		 352 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.511537  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1187  flagellar hook-length control protein  36.84 
 
 		 512 aa  65.9  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3223  flagellar hook-length control protein FliK  33.33 
 
 		 527 aa  63.2  0.000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1354  flagellar hook-length control protein  36.36 
 
 		 585 aa  62.8  0.000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1347  flagellar hook-length control protein  36.36 
 
 		 579 aa  62.8  0.000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.371823 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1964  Flagellar hook-length control protein-like protein  31.03 
 
 		 324 aa  62  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.727762  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1287  flagellar hook-length control protein  36.36 
 
 		 586 aa  62  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2571  flagellar hook-length control protein  37.65 
 
 		 491 aa  60.5  0.00000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3063  flagellar hook-length control protein  39.73 
 
 		 718 aa  58.5  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.954903  normal  0.750482 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2921  flagellar hook-length control protein  39.73 
 
 		 537 aa  58.9  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2931  flagellar hook-length control protein  39.73 
 
 		 717 aa  58.5  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0204  flagellar hook-length control protein  31.3 
 
 		 361 aa  58.2  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.504865 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1442  flagellar hook-length control protein  39.73 
 
 		 702 aa  58.2  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.822312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1366  flagellar hook-length control protein  33.33 
 
 		 508 aa  57.4  0.0000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0658  flagellar hook-length control protein  32.53 
 
 		 365 aa  56.6  0.0000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1329  flagellar hook-length control protein  34.29 
 
 		 495 aa  56.2  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.214505  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2354  flagellar hook-length control protein  34.44 
 
 		 487 aa  55.1  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1623  flagellar hook-length control protein  36.99 
 
 		 544 aa  55.5  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3888  hypothetical protein  33.33 
 
 		 428 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.669233  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45830  hypothetical protein  33.33 
 
 		 427 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0493  flagellar hook-length control protein  33.33 
 
 		 460 aa  53.5  0.000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3916  flagellar hook-length control protein  25.13 
 
 		 656 aa  52.8  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.108844 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03156  hypothetical protein  32.04 
 
 		 686 aa  52.8  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3832  flagellar hook-length control protein  28.99 
 
 		 660 aa  52  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1711  putative flagellar hook-length control protein FliK  34.85 
 
 		 674 aa  51.6  0.00003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2905  flagellar hook-length control protein  41.94 
 
 		 478 aa  50.1  0.00006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2534  flagellar hook-length control protein  32.94 
 
 		 407 aa  50.1  0.00007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.658569 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2817  flagellar hook-length control protein  42.31 
 
 		 408 aa  49.7  0.00008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0900744 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00976  flagellar protein  34.12 
 
 		 434 aa  49.3  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.113548  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2292  flagellar hook-length control protein FliK  41.38 
 
 		 593 aa  49.3  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.755689 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002820  flagellar hook-length control protein FliK  30.1 
 
 		 623 aa  49.7  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06190  flagellar protein  34.12 
 
 		 434 aa  49.3  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0480838  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0416  hypothetical protein  28.93 
 
 		 479 aa  48.9  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1989  flagellar hook-length control protein  35 
 
 		 394 aa  48.9  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3432  flagellar hook-length control protein  30.09 
 
 		 570 aa  48.5  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0179  flagellar hook-length control protein, putative  30.61 
 
 		 381 aa  48.1  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.501207  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0714  flagellar hook-length control protein  40.32 
 
 		 369 aa  47.8  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2719  flagellar hook-length control protein  32.22 
 
 		 375 aa  47.8  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.243255  normal  0.82206 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2176  flagellar hook-length control protein  32.22 
 
 		 375 aa  47.8  0.0004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000764801  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2043  flagellar hook-length control protein  32.22 
 
 		 375 aa  47.4  0.0004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.436184  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1699  flagellar hook-length control protein  32.22 
 
 		 375 aa  47.4  0.0004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0151155 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1705  flagellar hook-length control protein  32.22 
 
 		 375 aa  47.4  0.0004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.195068  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1241  flagellar hook-length control protein  32.22 
 
 		 375 aa  47.4  0.0004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.896281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0231  flagellar hook-length control protein, putative  30 
 
 		 380 aa  47.4  0.0004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02883  polar flagellar hook-length control protein FliK  31.18 
 
 		 768 aa  47.4  0.0005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0438685  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3061  flagellar hook-length control protein  34.55 
 
 		 609 aa  46.6  0.0007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.15551  normal  0.0461289 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1163  flagellar hook-length control protein  27.01 
 
 		 364 aa  46.2  0.0009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.193048  normal  0.0180974 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2303  polar flagellar hook-length control protein FliK  26.88 
 
 		 407 aa  46.2  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0280  lateral flagellar hook length control protein LafE  29.63 
 
 		 353 aa  46.2  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00112639  normal  0.832846 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3354  flagellar hook-length control protein  29.17 
 
 		 353 aa  45.8  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.26505  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2132  flagellar hook-length control protein  31.4 
 
 		 407 aa  44.7  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.151481 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2190  flagellar hook-length control protein  31.4 
 
 		 405 aa  44.3  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.543478 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1145  flagellar hook-length control protein  31.4 
 
 		 407 aa  44.7  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.475671  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1268  flagellar hook-length control protein  31.4 
 
 		 405 aa  44.3  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2137  flagellar hook-length control protein  31.4 
 
 		 407 aa  44.3  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000644258 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4207  flagellar hook-length control protein  29.35 
 
 		 604 aa  44.7  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1544  flagellar hook-length control protein  33.82 
 
 		 453 aa  44.3  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.213285  normal  0.574566 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1966  flagellar hook-length control protein FliK  26.32 
 
 		 474 aa  43.9  0.006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.471768  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3449  flagellar hook-length control protein  26.32 
 
 		 467 aa  43.1  0.007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.715571 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>