113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_1544 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007492  Pfl01_1544  flagellar hook-length control protein  100 
 
 
453 aa  898    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.213285  normal  0.574566 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4361  flagellar hook-length control protein  43.97 
 
 
421 aa  282  7.000000000000001e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.446802 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3686  flagellar hook-length control protein  44.09 
 
 
435 aa  279  6e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.373199  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1506  flagellar hook-length control protein  44.19 
 
 
421 aa  278  2e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.374735  normal  0.0562001 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1966  flagellar hook-length control protein FliK  41.14 
 
 
474 aa  277  3e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.471768  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3922  flagellar hook-length control protein  43.25 
 
 
421 aa  270  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3449  flagellar hook-length control protein  42.46 
 
 
467 aa  260  3e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.715571 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3888  hypothetical protein  37.37 
 
 
428 aa  210  4e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.669233  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45830  hypothetical protein  37.01 
 
 
427 aa  204  2e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2817  flagellar hook-length control protein  37.26 
 
 
408 aa  186  8e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0900744 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3439  flagellar hook-length control protein  34.69 
 
 
567 aa  89.7  1e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2354  flagellar hook-length control protein  35.76 
 
 
487 aa  87.4  5e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1711  putative flagellar hook-length control protein FliK  41.04 
 
 
674 aa  81.3  0.00000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0493  flagellar hook-length control protein  39.62 
 
 
460 aa  76.3  0.000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1964  Flagellar hook-length control protein-like protein  39.09 
 
 
324 aa  74.3  0.000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.727762  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1437  flagellar hook-length control protein  30.34 
 
 
650 aa  73.6  0.000000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1989  flagellar hook-length control protein  34.58 
 
 
394 aa  73.6  0.000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2303  polar flagellar hook-length control protein FliK  35.96 
 
 
407 aa  73.6  0.000000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2177  flagellar hook-length control protein-like  41.3 
 
 
485 aa  70.9  0.00000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.025521  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1163  flagellar hook-length control protein  29.95 
 
 
364 aa  66.2  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.193048  normal  0.0180974 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0161  putative flagellar hook-length control protein  34.58 
 
 
487 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.409738 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6418  flagellar hook-length control protein  33.64 
 
 
447 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.865119 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0714  flagellar hook-length control protein  35.29 
 
 
369 aa  64.7  0.000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0768  flagellar hook-length control protein  29.03 
 
 
335 aa  64.3  0.000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.383944  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03156  hypothetical protein  38.55 
 
 
686 aa  63.9  0.000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1329  flagellar hook-length control protein  28.78 
 
 
495 aa  62.8  0.00000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.214505  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1366  flagellar hook-length control protein  33.33 
 
 
508 aa  63.2  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2571  flagellar hook-length control protein  32.86 
 
 
491 aa  62.4  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2905  flagellar hook-length control protein  30.77 
 
 
478 aa  62  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3223  flagellar hook-length control protein FliK  32.12 
 
 
527 aa  61.6  0.00000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1651  hypothetical protein  29.52 
 
 
420 aa  61.2  0.00000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002820  flagellar hook-length control protein FliK  38.55 
 
 
623 aa  61.6  0.00000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1187  flagellar hook-length control protein  35 
 
 
512 aa  61.6  0.00000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1875  flagellar hook-length control protein  29.03 
 
 
389 aa  61.2  0.00000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.521735  normal  0.436582 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1960  flagellar hook-length control protein  28.08 
 
 
456 aa  60.8  0.00000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1605  putative flagellar hook-length control protein FliK  36.14 
 
 
360 aa  60.5  0.00000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.107418 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3114  flagellar hook-length control protein  32.08 
 
 
455 aa  60.5  0.00000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1657  hypothetical protein  28.92 
 
 
414 aa  60.1  0.00000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1354  flagellar hook-length control protein  31.39 
 
 
585 aa  60.1  0.00000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1350  flagellar hook-length control protein  32.17 
 
 
480 aa  59.3  0.0000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.457332  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1347  flagellar hook-length control protein  29.2 
 
 
579 aa  59.3  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.371823 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4173  flagellar hook-length control protein  31.73 
 
 
452 aa  59.7  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.717786  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1507  putative flagellar hook-length control protein  27.95 
 
 
660 aa  58.5  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.838135  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3775  flagellar hook-length control protein  33.33 
 
 
497 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1287  flagellar hook-length control protein  30.66 
 
 
586 aa  58.5  0.0000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24180  Flagellar hook-length control protein  28.47 
 
 
461 aa  58.2  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0290673  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2396  flagellar hook-length control protein  37.8 
 
 
450 aa  58.2  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0195  flagellar hook-length control protein, putative  32.14 
 
 
465 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2455  flagellar hook-length control protein  32.14 
 
 
452 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0513152  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3069  flagellar hook-length control protein  32.14 
 
 
452 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.127947  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3061  flagellar hook-length control protein  27.56 
 
 
609 aa  57.8  0.0000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.15551  normal  0.0461289 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3066  flagellar hook-length control protein  33.33 
 
 
449 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3088  flagellar hook-length control protein  32.14 
 
 
456 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.140483  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0217  flagellar hook-length control protein FliK  32.14 
 
 
455 aa  57.8  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.478387  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2295  flagellar hook-length control protein  37.8 
 
 
452 aa  57.4  0.0000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2980  flagellar hook-length control protein  32.14 
 
 
455 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.741778  normal  0.672643 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1623  flagellar hook-length control protein  32.85 
 
 
544 aa  57  0.0000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3276  flagellar hook-length control protein  32.14 
 
 
466 aa  56.6  0.0000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3405  flagellar hook-length control protein  32.14 
 
 
466 aa  56.6  0.0000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2147  flagellar hook-length control protein  32.14 
 
 
458 aa  56.6  0.0000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0229  flagellar hook-length control protein FliK  32.14 
 
 
458 aa  56.6  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.541873  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3649  flagellar hook-length control protein  31.25 
 
 
525 aa  55.8  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.609424  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4726  flagellar hook-length control protein  31.25 
 
 
525 aa  55.8  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0477829 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0412  flagellar hook-length control protein, putative  32.14 
 
 
677 aa  55.5  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.711006  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2292  flagellar hook-length control protein FliK  28.83 
 
 
593 aa  55.8  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.755689 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2936  flagellar hook-length control protein  30.69 
 
 
503 aa  55.5  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1973  flagellar hook-length control protein  30.88 
 
 
373 aa  54.3  0.000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1646  flagellar hook-length control protein  30.36 
 
 
589 aa  54.3  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.925777 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02883  polar flagellar hook-length control protein FliK  27.85 
 
 
768 aa  54.3  0.000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0438685  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2580  flagellar hook-length control protein  26.57 
 
 
431 aa  53.9  0.000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.549964  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3063  flagellar hook-length control protein  28.23 
 
 
718 aa  53.9  0.000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.954903  normal  0.750482 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0395  flagellar hook-length control protein  29.79 
 
 
516 aa  53.5  0.000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.475932  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1442  flagellar hook-length control protein  28.23 
 
 
702 aa  53.5  0.000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.822312  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3106  flagellar hook-length control protein  34.92 
 
 
479 aa  53.1  0.000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1886  flagellar hook-length control protein  29.35 
 
 
430 aa  53.1  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1545  flagellar hook-length control protein  30.43 
 
 
523 aa  53.1  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3635  flagellar hook-length control protein  30 
 
 
438 aa  52  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.225852  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00976  flagellar protein  28.16 
 
 
434 aa  51.2  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.113548  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06190  flagellar protein  28.16 
 
 
434 aa  51.2  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0480838  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5102  flagellar hook-length control protein  31.71 
 
 
487 aa  50.8  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.290575  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1571  flagellar hook-length control protein  29.27 
 
 
443 aa  51.2  0.00004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.112044  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1371  flagellar hook-length control protein  35.53 
 
 
568 aa  50.4  0.00006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.358506  normal  0.685511 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2931  flagellar hook-length control protein  29.03 
 
 
717 aa  50.4  0.00006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3963  flagellar hook-length control protein  28.14 
 
 
526 aa  50.1  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.687066  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2952  flagellar hook-length control protein  32.93 
 
 
407 aa  50.1  0.00008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2132  flagellar hook-length control protein  28.28 
 
 
407 aa  50.1  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.151481 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0438  flagellar hook-length control protein  25.42 
 
 
504 aa  49.7  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00196038  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04953  flagellar hook-length control protein  37.78 
 
 
351 aa  49.3  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2137  flagellar hook-length control protein  28.28 
 
 
407 aa  49.3  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000644258 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2190  flagellar hook-length control protein  28.28 
 
 
405 aa  49.7  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.543478 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1145  flagellar hook-length control protein  28.28 
 
 
407 aa  49.7  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.475671  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1268  flagellar hook-length control protein  28.28 
 
 
405 aa  49.7  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5266  flagellar hook-length control protein  31.71 
 
 
495 aa  48.5  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.265097 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2921  flagellar hook-length control protein  32.89 
 
 
537 aa  48.1  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1693  flagellar hook-length control protein  30.48 
 
 
703 aa  47.8  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.695536  hitchhiker  0.000339817 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2176  flagellar hook-length control protein  27.74 
 
 
375 aa  47.8  0.0004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000764801  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1705  flagellar hook-length control protein  27.74 
 
 
375 aa  47.8  0.0005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.195068  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0058  FliK, flagellar hook-length control protein  30.1 
 
 
699 aa  47.4  0.0005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3451  flagellar hook-length control protein  36.76 
 
 
393 aa  47.4  0.0005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2043  flagellar hook-length control protein  27.74 
 
 
375 aa  47.8  0.0005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.436184  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>